Protein–RNA interactions for Protein: P57716

Ncstn, Nicastrin, mousemouse

Predictions only

Length 708 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NcstnP57716 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
NcstnP57716 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
NcstnP57716 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
NcstnP57716 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
NcstnP57716 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
NcstnP57716 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
NcstnP57716 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
NcstnP57716 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
NcstnP57716 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
NcstnP57716 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
NcstnP57716 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
NcstnP57716 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
NcstnP57716 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
NcstnP57716 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
NcstnP57716 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
NcstnP57716 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
NcstnP57716 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
NcstnP57716 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
NcstnP57716 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
NcstnP57716 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
NcstnP57716 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
NcstnP57716 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
NcstnP57716 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
NcstnP57716 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
NcstnP57716 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
NcstnP57716 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
NcstnP57716 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
NcstnP57716 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
NcstnP57716 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
NcstnP57716 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
NcstnP57716 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC19■□□□□ 0.63
NcstnP57716 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NcstnP57716 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NcstnP57716 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NcstnP57716 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NcstnP57716 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NcstnP57716 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NcstnP57716 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC19■□□□□ 0.63
NcstnP57716 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NcstnP57716 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
NcstnP57716 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NcstnP57716 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NcstnP57716 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
NcstnP57716 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
NcstnP57716 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NcstnP57716 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NcstnP57716 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NcstnP57716 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NcstnP57716 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NcstnP57716 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NcstnP57716 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NcstnP57716 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
NcstnP57716 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
NcstnP57716 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
NcstnP57716 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
NcstnP57716 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
NcstnP57716 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
NcstnP57716 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
NcstnP57716 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
NcstnP57716 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
NcstnP57716 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
NcstnP57716 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
NcstnP57716 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
NcstnP57716 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
NcstnP57716 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
NcstnP57716 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
NcstnP57716 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
NcstnP57716 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
NcstnP57716 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
NcstnP57716 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
NcstnP57716 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
NcstnP57716 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
NcstnP57716 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
NcstnP57716 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
NcstnP57716 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
NcstnP57716 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
NcstnP57716 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
NcstnP57716 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
NcstnP57716 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
NcstnP57716 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
NcstnP57716 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
NcstnP57716 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
NcstnP57716 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
NcstnP57716 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
NcstnP57716 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
NcstnP57716 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
NcstnP57716 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
NcstnP57716 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
NcstnP57716 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
NcstnP57716 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
NcstnP57716 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
NcstnP57716 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
NcstnP57716 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
NcstnP57716 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
NcstnP57716 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
NcstnP57716 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
NcstnP57716 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
NcstnP57716 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
NcstnP57716 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
NcstnP57716 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms