Protein–RNA interactions for Protein: P56542

Dnase2, Deoxyribonuclease-2-alpha, mousemouse

Predictions only

Length 353 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnase2P56542 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Dnase2P56542 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Dnase2P56542 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Dnase2P56542 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Dnase2P56542 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Dnase2P56542 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Dnase2P56542 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Dnase2P56542 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Dnase2P56542 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Dnase2P56542 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Dnase2P56542 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Dnase2P56542 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Dnase2P56542 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Dnase2P56542 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Dnase2P56542 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Dnase2P56542 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Dnase2P56542 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Dnase2P56542 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Dnase2P56542 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Dnase2P56542 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Dnase2P56542 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Dnase2P56542 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Dnase2P56542 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Dnase2P56542 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Dnase2P56542 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Dnase2P56542 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Dnase2P56542 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Dnase2P56542 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Dnase2P56542 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Dnase2P56542 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Dnase2P56542 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Dnase2P56542 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Dnase2P56542 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Dnase2P56542 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Dnase2P56542 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Dnase2P56542 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Dnase2P56542 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Dnase2P56542 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Dnase2P56542 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Dnase2P56542 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Dnase2P56542 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Dnase2P56542 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Dnase2P56542 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Dnase2P56542 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Dnase2P56542 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Dnase2P56542 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Dnase2P56542 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Dnase2P56542 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Dnase2P56542 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Dnase2P56542 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Dnase2P56542 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Dnase2P56542 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Dnase2P56542 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Dnase2P56542 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Dnase2P56542 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Dnase2P56542 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Dnase2P56542 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Dnase2P56542 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Dnase2P56542 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Dnase2P56542 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Dnase2P56542 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Dnase2P56542 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Dnase2P56542 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Dnase2P56542 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Dnase2P56542 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Dnase2P56542 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Dnase2P56542 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Dnase2P56542 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Dnase2P56542 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Dnase2P56542 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Dnase2P56542 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Dnase2P56542 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Dnase2P56542 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Dnase2P56542 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Dnase2P56542 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Dnase2P56542 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Dnase2P56542 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Dnase2P56542 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Dnase2P56542 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Dnase2P56542 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Dnase2P56542 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Dnase2P56542 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Dnase2P56542 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Dnase2P56542 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Dnase2P56542 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Dnase2P56542 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Dnase2P56542 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Dnase2P56542 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Dnase2P56542 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Dnase2P56542 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Dnase2P56542 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Dnase2P56542 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Dnase2P56542 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Dnase2P56542 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Dnase2P56542 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Dnase2P56542 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Dnase2P56542 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Dnase2P56542 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Dnase2P56542 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Dnase2P56542 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.6 ms