Protein–RNA interactions for Protein: P56528

Cd38, ADP-ribosyl cyclase/cyclic ADP-ribose hydrolase 1, mousemouse

Predictions only

Length 304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd38P56528 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cd38P56528 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cd38P56528 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cd38P56528 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cd38P56528 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Cd38P56528 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cd38P56528 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cd38P56528 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cd38P56528 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cd38P56528 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cd38P56528 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cd38P56528 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cd38P56528 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cd38P56528 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cd38P56528 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cd38P56528 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cd38P56528 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cd38P56528 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cd38P56528 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cd38P56528 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cd38P56528 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cd38P56528 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cd38P56528 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cd38P56528 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cd38P56528 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cd38P56528 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cd38P56528 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cd38P56528 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cd38P56528 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cd38P56528 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cd38P56528 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cd38P56528 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cd38P56528 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cd38P56528 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cd38P56528 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cd38P56528 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cd38P56528 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cd38P56528 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Cd38P56528 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Cd38P56528 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Cd38P56528 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Cd38P56528 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Cd38P56528 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Cd38P56528 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Cd38P56528 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cd38P56528 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cd38P56528 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cd38P56528 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cd38P56528 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Cd38P56528 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cd38P56528 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cd38P56528 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cd38P56528 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cd38P56528 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cd38P56528 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cd38P56528 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cd38P56528 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cd38P56528 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cd38P56528 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cd38P56528 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cd38P56528 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cd38P56528 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cd38P56528 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cd38P56528 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cd38P56528 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cd38P56528 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cd38P56528 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cd38P56528 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cd38P56528 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cd38P56528 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cd38P56528 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Cd38P56528 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cd38P56528 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cd38P56528 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cd38P56528 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cd38P56528 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cd38P56528 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cd38P56528 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cd38P56528 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cd38P56528 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cd38P56528 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cd38P56528 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cd38P56528 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Cd38P56528 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cd38P56528 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cd38P56528 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cd38P56528 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cd38P56528 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cd38P56528 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cd38P56528 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cd38P56528 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cd38P56528 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Cd38P56528 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Cd38P56528 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Cd38P56528 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cd38P56528 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cd38P56528 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cd38P56528 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cd38P56528 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cd38P56528 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms