Protein–RNA interactions for Protein: P56183

Rrp1, Ribosomal RNA processing protein 1 homolog A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrp1P56183 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rrp1P56183 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rrp1P56183 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rrp1P56183 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rrp1P56183 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Rrp1P56183 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Rrp1P56183 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rrp1P56183 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Rrp1P56183 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Rrp1P56183 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rrp1P56183 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Rrp1P56183 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rrp1P56183 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Rrp1P56183 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rrp1P56183 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rrp1P56183 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rrp1P56183 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rrp1P56183 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rrp1P56183 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rrp1P56183 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rrp1P56183 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Rrp1P56183 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Rrp1P56183 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Rrp1P56183 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Rrp1P56183 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Rrp1P56183 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Rrp1P56183 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
Rrp1P56183 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Rrp1P56183 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Rrp1P56183 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Rrp1P56183 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Rrp1P56183 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Rrp1P56183 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rrp1P56183 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rrp1P56183 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rrp1P56183 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rrp1P56183 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rrp1P56183 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rrp1P56183 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rrp1P56183 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rrp1P56183 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rrp1P56183 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rrp1P56183 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rrp1P56183 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rrp1P56183 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rrp1P56183 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rrp1P56183 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rrp1P56183 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rrp1P56183 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rrp1P56183 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Rrp1P56183 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rrp1P56183 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rrp1P56183 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rrp1P56183 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Rrp1P56183 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rrp1P56183 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Rrp1P56183 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rrp1P56183 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rrp1P56183 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rrp1P56183 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rrp1P56183 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rrp1P56183 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rrp1P56183 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rrp1P56183 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rrp1P56183 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rrp1P56183 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rrp1P56183 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rrp1P56183 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rrp1P56183 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rrp1P56183 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rrp1P56183 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rrp1P56183 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rrp1P56183 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rrp1P56183 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rrp1P56183 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rrp1P56183 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Rrp1P56183 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rrp1P56183 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Rrp1P56183 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rrp1P56183 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rrp1P56183 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rrp1P56183 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rrp1P56183 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rrp1P56183 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rrp1P56183 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rrp1P56183 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rrp1P56183 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rrp1P56183 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rrp1P56183 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Rrp1P56183 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rrp1P56183 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Rrp1P56183 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rrp1P56183 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rrp1P56183 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rrp1P56183 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rrp1P56183 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rrp1P56183 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rrp1P56183 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rrp1P56183 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rrp1P56183 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms