Protein–RNA interactions for Protein: P54285

Cacnb3, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-3, mousemouse

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacnb3P54285 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cacnb3P54285 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cacnb3P54285 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cacnb3P54285 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cacnb3P54285 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Cacnb3P54285 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Cacnb3P54285 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Cacnb3P54285 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cacnb3P54285 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cacnb3P54285 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cacnb3P54285 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cacnb3P54285 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cacnb3P54285 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cacnb3P54285 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cacnb3P54285 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cacnb3P54285 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cacnb3P54285 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cacnb3P54285 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cacnb3P54285 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cacnb3P54285 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cacnb3P54285 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cacnb3P54285 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cacnb3P54285 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cacnb3P54285 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cacnb3P54285 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cacnb3P54285 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Cacnb3P54285 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cacnb3P54285 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cacnb3P54285 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cacnb3P54285 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cacnb3P54285 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cacnb3P54285 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cacnb3P54285 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Cacnb3P54285 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cacnb3P54285 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cacnb3P54285 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cacnb3P54285 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cacnb3P54285 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cacnb3P54285 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cacnb3P54285 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cacnb3P54285 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cacnb3P54285 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cacnb3P54285 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cacnb3P54285 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Cacnb3P54285 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Cacnb3P54285 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cacnb3P54285 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cacnb3P54285 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cacnb3P54285 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cacnb3P54285 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Cacnb3P54285 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cacnb3P54285 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cacnb3P54285 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cacnb3P54285 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cacnb3P54285 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cacnb3P54285 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cacnb3P54285 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cacnb3P54285 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cacnb3P54285 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cacnb3P54285 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cacnb3P54285 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cacnb3P54285 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Cacnb3P54285 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Cacnb3P54285 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Cacnb3P54285 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cacnb3P54285 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cacnb3P54285 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cacnb3P54285 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cacnb3P54285 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cacnb3P54285 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cacnb3P54285 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cacnb3P54285 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Cacnb3P54285 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cacnb3P54285 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cacnb3P54285 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cacnb3P54285 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cacnb3P54285 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Cacnb3P54285 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cacnb3P54285 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cacnb3P54285 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cacnb3P54285 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cacnb3P54285 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Cacnb3P54285 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cacnb3P54285 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cacnb3P54285 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cacnb3P54285 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cacnb3P54285 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Cacnb3P54285 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cacnb3P54285 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cacnb3P54285 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cacnb3P54285 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Cacnb3P54285 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Cacnb3P54285 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cacnb3P54285 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cacnb3P54285 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cacnb3P54285 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cacnb3P54285 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cacnb3P54285 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cacnb3P54285 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cacnb3P54285 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40 ms