Protein–RNA interactions for Protein: P53808

Pctp, Phosphatidylcholine transfer protein, mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PctpP53808 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PctpP53808 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PctpP53808 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
PctpP53808 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PctpP53808 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PctpP53808 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PctpP53808 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PctpP53808 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PctpP53808 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PctpP53808 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PctpP53808 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PctpP53808 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PctpP53808 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PctpP53808 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PctpP53808 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PctpP53808 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PctpP53808 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PctpP53808 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PctpP53808 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PctpP53808 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
PctpP53808 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PctpP53808 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PctpP53808 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PctpP53808 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PctpP53808 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PctpP53808 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PctpP53808 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PctpP53808 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PctpP53808 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PctpP53808 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
PctpP53808 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PctpP53808 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PctpP53808 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PctpP53808 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PctpP53808 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PctpP53808 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PctpP53808 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PctpP53808 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PctpP53808 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PctpP53808 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PctpP53808 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PctpP53808 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PctpP53808 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PctpP53808 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PctpP53808 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PctpP53808 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PctpP53808 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PctpP53808 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PctpP53808 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
PctpP53808 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PctpP53808 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PctpP53808 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PctpP53808 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PctpP53808 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PctpP53808 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PctpP53808 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PctpP53808 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PctpP53808 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PctpP53808 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PctpP53808 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PctpP53808 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PctpP53808 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PctpP53808 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PctpP53808 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PctpP53808 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PctpP53808 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PctpP53808 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
PctpP53808 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PctpP53808 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PctpP53808 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PctpP53808 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PctpP53808 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PctpP53808 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
PctpP53808 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PctpP53808 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PctpP53808 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
PctpP53808 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PctpP53808 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PctpP53808 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PctpP53808 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PctpP53808 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PctpP53808 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PctpP53808 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PctpP53808 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PctpP53808 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PctpP53808 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PctpP53808 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PctpP53808 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PctpP53808 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PctpP53808 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PctpP53808 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PctpP53808 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PctpP53808 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PctpP53808 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PctpP53808 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PctpP53808 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
PctpP53808 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PctpP53808 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PctpP53808 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PctpP53808 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.9 ms