Protein–RNA interactions for Protein: P52795

Efnb1, Ephrin-B1, mousemouse

Predictions only

Length 345 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efnb1P52795 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Efnb1P52795 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Efnb1P52795 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Efnb1P52795 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Efnb1P52795 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Efnb1P52795 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Efnb1P52795 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Efnb1P52795 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Efnb1P52795 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Efnb1P52795 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Efnb1P52795 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Efnb1P52795 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Efnb1P52795 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Efnb1P52795 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Efnb1P52795 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Efnb1P52795 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Efnb1P52795 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Efnb1P52795 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Efnb1P52795 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Efnb1P52795 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Efnb1P52795 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Efnb1P52795 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Efnb1P52795 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Efnb1P52795 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Efnb1P52795 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Efnb1P52795 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Efnb1P52795 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Efnb1P52795 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Efnb1P52795 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Efnb1P52795 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Efnb1P52795 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Efnb1P52795 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Efnb1P52795 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Efnb1P52795 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Efnb1P52795 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Efnb1P52795 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Efnb1P52795 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Efnb1P52795 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Efnb1P52795 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Efnb1P52795 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Efnb1P52795 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Efnb1P52795 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Efnb1P52795 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Efnb1P52795 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Efnb1P52795 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Efnb1P52795 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Efnb1P52795 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Efnb1P52795 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Efnb1P52795 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Efnb1P52795 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Efnb1P52795 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Efnb1P52795 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Efnb1P52795 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Efnb1P52795 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Efnb1P52795 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Efnb1P52795 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Efnb1P52795 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Efnb1P52795 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Efnb1P52795 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Efnb1P52795 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Efnb1P52795 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Efnb1P52795 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Efnb1P52795 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Efnb1P52795 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Efnb1P52795 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Efnb1P52795 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Efnb1P52795 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Efnb1P52795 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Efnb1P52795 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Efnb1P52795 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Efnb1P52795 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Efnb1P52795 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Efnb1P52795 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Efnb1P52795 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Efnb1P52795 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Efnb1P52795 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Efnb1P52795 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Efnb1P52795 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Efnb1P52795 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Efnb1P52795 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Efnb1P52795 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Efnb1P52795 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Efnb1P52795 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Efnb1P52795 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Efnb1P52795 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Efnb1P52795 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Efnb1P52795 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Efnb1P52795 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Efnb1P52795 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Efnb1P52795 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Efnb1P52795 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Efnb1P52795 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Efnb1P52795 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Efnb1P52795 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Efnb1P52795 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Efnb1P52795 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Efnb1P52795 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Efnb1P52795 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Efnb1P52795 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Efnb1P52795 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.5 ms