Protein–RNA interactions for Protein: P50228

Cxcl5, C-X-C motif chemokine 5, mousemouse

Predictions only

Length 132 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcl5P50228 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cxcl5P50228 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cxcl5P50228 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cxcl5P50228 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cxcl5P50228 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Cxcl5P50228 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cxcl5P50228 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cxcl5P50228 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cxcl5P50228 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cxcl5P50228 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cxcl5P50228 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cxcl5P50228 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cxcl5P50228 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cxcl5P50228 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cxcl5P50228 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cxcl5P50228 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cxcl5P50228 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cxcl5P50228 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cxcl5P50228 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cxcl5P50228 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cxcl5P50228 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cxcl5P50228 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Cxcl5P50228 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cxcl5P50228 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cxcl5P50228 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cxcl5P50228 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cxcl5P50228 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cxcl5P50228 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cxcl5P50228 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cxcl5P50228 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cxcl5P50228 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cxcl5P50228 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cxcl5P50228 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Cxcl5P50228 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cxcl5P50228 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cxcl5P50228 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cxcl5P50228 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cxcl5P50228 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cxcl5P50228 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cxcl5P50228 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cxcl5P50228 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cxcl5P50228 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cxcl5P50228 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cxcl5P50228 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cxcl5P50228 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cxcl5P50228 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cxcl5P50228 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cxcl5P50228 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cxcl5P50228 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cxcl5P50228 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cxcl5P50228 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cxcl5P50228 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cxcl5P50228 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cxcl5P50228 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cxcl5P50228 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cxcl5P50228 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cxcl5P50228 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cxcl5P50228 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cxcl5P50228 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cxcl5P50228 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cxcl5P50228 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cxcl5P50228 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cxcl5P50228 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cxcl5P50228 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Cxcl5P50228 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cxcl5P50228 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cxcl5P50228 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cxcl5P50228 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cxcl5P50228 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cxcl5P50228 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cxcl5P50228 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cxcl5P50228 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cxcl5P50228 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cxcl5P50228 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cxcl5P50228 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cxcl5P50228 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cxcl5P50228 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cxcl5P50228 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cxcl5P50228 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cxcl5P50228 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cxcl5P50228 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Cxcl5P50228 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cxcl5P50228 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cxcl5P50228 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cxcl5P50228 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cxcl5P50228 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cxcl5P50228 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cxcl5P50228 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Cxcl5P50228 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Cxcl5P50228 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Cxcl5P50228 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cxcl5P50228 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cxcl5P50228 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cxcl5P50228 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cxcl5P50228 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cxcl5P50228 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cxcl5P50228 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Cxcl5P50228 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cxcl5P50228 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cxcl5P50228 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.1 ms