Protein–RNA interactions for Protein: P47968

Rpia, Ribose-5-phosphate isomerase, mousemouse

Predictions only

Length 303 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RpiaP47968 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RpiaP47968 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RpiaP47968 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RpiaP47968 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RpiaP47968 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RpiaP47968 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
RpiaP47968 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RpiaP47968 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
RpiaP47968 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
RpiaP47968 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RpiaP47968 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RpiaP47968 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RpiaP47968 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RpiaP47968 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RpiaP47968 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
RpiaP47968 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
RpiaP47968 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RpiaP47968 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RpiaP47968 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RpiaP47968 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RpiaP47968 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RpiaP47968 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RpiaP47968 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RpiaP47968 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RpiaP47968 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RpiaP47968 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RpiaP47968 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
RpiaP47968 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RpiaP47968 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RpiaP47968 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
RpiaP47968 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RpiaP47968 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RpiaP47968 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
RpiaP47968 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RpiaP47968 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RpiaP47968 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RpiaP47968 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RpiaP47968 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RpiaP47968 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RpiaP47968 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RpiaP47968 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RpiaP47968 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RpiaP47968 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RpiaP47968 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RpiaP47968 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RpiaP47968 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RpiaP47968 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RpiaP47968 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RpiaP47968 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RpiaP47968 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RpiaP47968 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RpiaP47968 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RpiaP47968 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RpiaP47968 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RpiaP47968 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RpiaP47968 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
RpiaP47968 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
RpiaP47968 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
RpiaP47968 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
RpiaP47968 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
RpiaP47968 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
RpiaP47968 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RpiaP47968 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RpiaP47968 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RpiaP47968 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RpiaP47968 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RpiaP47968 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RpiaP47968 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RpiaP47968 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RpiaP47968 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RpiaP47968 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RpiaP47968 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RpiaP47968 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RpiaP47968 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RpiaP47968 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RpiaP47968 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RpiaP47968 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RpiaP47968 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RpiaP47968 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RpiaP47968 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RpiaP47968 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RpiaP47968 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RpiaP47968 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RpiaP47968 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RpiaP47968 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RpiaP47968 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RpiaP47968 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
RpiaP47968 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RpiaP47968 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RpiaP47968 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RpiaP47968 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RpiaP47968 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RpiaP47968 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RpiaP47968 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RpiaP47968 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RpiaP47968 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RpiaP47968 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
RpiaP47968 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RpiaP47968 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RpiaP47968 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms