Protein–RNA interactions for Protein: P35436

Grin2a, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2A, mousemouse

Predictions only

Length 1,464 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grin2aP35436 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Grin2aP35436 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Grin2aP35436 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC30■■■□□ 2.39
Grin2aP35436 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Grin2aP35436 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Grin2aP35436 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Grin2aP35436 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Grin2aP35436 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Grin2aP35436 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
Grin2aP35436 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
Grin2aP35436 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
Grin2aP35436 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
Grin2aP35436 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
Grin2aP35436 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
Grin2aP35436 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
Grin2aP35436 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
Grin2aP35436 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Grin2aP35436 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Grin2aP35436 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Grin2aP35436 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Grin2aP35436 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC29.98■■■□□ 2.39
Grin2aP35436 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Grin2aP35436 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC29.98■■■□□ 2.39
Grin2aP35436 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC29.98■■■□□ 2.39
Grin2aP35436 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Grin2aP35436 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
Grin2aP35436 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
Grin2aP35436 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC29.97■■■□□ 2.39
Grin2aP35436 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
Grin2aP35436 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC29.97■■■□□ 2.39
Grin2aP35436 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
Grin2aP35436 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC29.96■■■□□ 2.39
Grin2aP35436 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Grin2aP35436 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
Grin2aP35436 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.39
Grin2aP35436 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.39
Grin2aP35436 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
Grin2aP35436 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
Grin2aP35436 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
Grin2aP35436 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC29.94■■■□□ 2.38
Grin2aP35436 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Grin2aP35436 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
Grin2aP35436 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC29.94■■■□□ 2.38
Grin2aP35436 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Grin2aP35436 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Grin2aP35436 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Grin2aP35436 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Grin2aP35436 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
Grin2aP35436 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Grin2aP35436 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.93■■■□□ 2.38
Grin2aP35436 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC29.93■■■□□ 2.38
Grin2aP35436 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
Grin2aP35436 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Grin2aP35436 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Grin2aP35436 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Grin2aP35436 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Grin2aP35436 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Grin2aP35436 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC29.93■■■□□ 2.38
Grin2aP35436 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Grin2aP35436 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Grin2aP35436 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Grin2aP35436 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Grin2aP35436 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
Grin2aP35436 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC29.93■■■□□ 2.38
Grin2aP35436 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
Grin2aP35436 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Grin2aP35436 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
Grin2aP35436 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Grin2aP35436 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Grin2aP35436 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC29.92■■■□□ 2.38
Grin2aP35436 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC29.92■■■□□ 2.38
Grin2aP35436 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC29.92■■■□□ 2.38
Grin2aP35436 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Grin2aP35436 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
Grin2aP35436 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Grin2aP35436 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Grin2aP35436 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC29.91■■■□□ 2.38
Grin2aP35436 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Grin2aP35436 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Grin2aP35436 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC29.91■■■□□ 2.38
Grin2aP35436 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC29.91■■■□□ 2.38
Grin2aP35436 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Grin2aP35436 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Grin2aP35436 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Grin2aP35436 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Grin2aP35436 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Grin2aP35436 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Grin2aP35436 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
Grin2aP35436 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC29.89■■■□□ 2.38
Grin2aP35436 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
Grin2aP35436 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
Grin2aP35436 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
Grin2aP35436 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
Grin2aP35436 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
Grin2aP35436 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.37
Grin2aP35436 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Grin2aP35436 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
Grin2aP35436 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC29.88■■■□□ 2.37
Grin2aP35436 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Grin2aP35436 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms