Protein–RNA interactions for Protein: P26369

U2af2, Splicing factor U2AF 65 kDa subunit, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U2af2P26369 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
U2af2P26369 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
U2af2P26369 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
U2af2P26369 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
U2af2P26369 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
U2af2P26369 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
U2af2P26369 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
U2af2P26369 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
U2af2P26369 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
U2af2P26369 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
U2af2P26369 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
U2af2P26369 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
U2af2P26369 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
U2af2P26369 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
U2af2P26369 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
U2af2P26369 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
U2af2P26369 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
U2af2P26369 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
U2af2P26369 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
U2af2P26369 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
U2af2P26369 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
U2af2P26369 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
U2af2P26369 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
U2af2P26369 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
U2af2P26369 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
U2af2P26369 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
U2af2P26369 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
U2af2P26369 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
U2af2P26369 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
U2af2P26369 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
U2af2P26369 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
U2af2P26369 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
U2af2P26369 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
U2af2P26369 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
U2af2P26369 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
U2af2P26369 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
U2af2P26369 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
U2af2P26369 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
U2af2P26369 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
U2af2P26369 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
U2af2P26369 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
U2af2P26369 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
U2af2P26369 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
U2af2P26369 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
U2af2P26369 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
U2af2P26369 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
U2af2P26369 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
U2af2P26369 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
U2af2P26369 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
U2af2P26369 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
U2af2P26369 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
U2af2P26369 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
U2af2P26369 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
U2af2P26369 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
U2af2P26369 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
U2af2P26369 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
U2af2P26369 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
U2af2P26369 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
U2af2P26369 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
U2af2P26369 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
U2af2P26369 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
U2af2P26369 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
U2af2P26369 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
U2af2P26369 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
U2af2P26369 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
U2af2P26369 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
U2af2P26369 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
U2af2P26369 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
U2af2P26369 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
U2af2P26369 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
U2af2P26369 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
U2af2P26369 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
U2af2P26369 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
U2af2P26369 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
U2af2P26369 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
U2af2P26369 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
U2af2P26369 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
U2af2P26369 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
U2af2P26369 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
U2af2P26369 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
U2af2P26369 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
U2af2P26369 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
U2af2P26369 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
U2af2P26369 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
U2af2P26369 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
U2af2P26369 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
U2af2P26369 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
U2af2P26369 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
U2af2P26369 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
U2af2P26369 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
U2af2P26369 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
U2af2P26369 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
U2af2P26369 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
U2af2P26369 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
U2af2P26369 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
U2af2P26369 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
U2af2P26369 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
U2af2P26369 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
U2af2P26369 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
U2af2P26369 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.1 ms