Protein–RNA interactions for Protein: P23298

Prkch, Protein kinase C eta type, mousemouse

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Length 683 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkchP23298 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
PrkchP23298 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC19.75■□□□□ 0.75
PrkchP23298 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
PrkchP23298 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
PrkchP23298 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
PrkchP23298 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
PrkchP23298 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
PrkchP23298 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
PrkchP23298 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
PrkchP23298 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
PrkchP23298 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
PrkchP23298 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
PrkchP23298 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
PrkchP23298 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
PrkchP23298 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
PrkchP23298 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
PrkchP23298 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
PrkchP23298 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
PrkchP23298 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
PrkchP23298 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
PrkchP23298 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
PrkchP23298 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
PrkchP23298 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
PrkchP23298 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
PrkchP23298 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
PrkchP23298 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
PrkchP23298 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
PrkchP23298 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC19.74■□□□□ 0.75
PrkchP23298 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
PrkchP23298 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
PrkchP23298 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
PrkchP23298 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
PrkchP23298 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
PrkchP23298 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC19.73■□□□□ 0.75
PrkchP23298 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
PrkchP23298 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
PrkchP23298 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
PrkchP23298 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
PrkchP23298 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
PrkchP23298 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
PrkchP23298 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
PrkchP23298 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
PrkchP23298 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
PrkchP23298 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
PrkchP23298 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
PrkchP23298 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
PrkchP23298 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
PrkchP23298 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
PrkchP23298 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC19.71■□□□□ 0.75
PrkchP23298 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
PrkchP23298 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
PrkchP23298 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
PrkchP23298 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
PrkchP23298 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
PrkchP23298 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
PrkchP23298 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
PrkchP23298 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
PrkchP23298 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
PrkchP23298 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
PrkchP23298 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
PrkchP23298 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
PrkchP23298 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
PrkchP23298 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
PrkchP23298 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
PrkchP23298 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PrkchP23298 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
PrkchP23298 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PrkchP23298 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC19.7■□□□□ 0.74
PrkchP23298 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PrkchP23298 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
PrkchP23298 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PrkchP23298 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
PrkchP23298 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
PrkchP23298 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PrkchP23298 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
PrkchP23298 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
PrkchP23298 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PrkchP23298 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PrkchP23298 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC19.7■□□□□ 0.74
PrkchP23298 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PrkchP23298 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PrkchP23298 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PrkchP23298 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
PrkchP23298 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PrkchP23298 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
PrkchP23298 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
PrkchP23298 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
PrkchP23298 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
PrkchP23298 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
PrkchP23298 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
PrkchP23298 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
PrkchP23298 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
PrkchP23298 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
PrkchP23298 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
PrkchP23298 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
PrkchP23298 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
PrkchP23298 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
PrkchP23298 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
PrkchP23298 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
PrkchP23298 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
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