Protein–RNA interactions for Protein: P21237

Bdnf, Brain-derived neurotrophic factor, mousemouse

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BdnfP21237 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
BdnfP21237 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
BdnfP21237 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
BdnfP21237 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
BdnfP21237 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
BdnfP21237 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
BdnfP21237 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
BdnfP21237 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
BdnfP21237 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
BdnfP21237 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
BdnfP21237 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
BdnfP21237 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
BdnfP21237 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
BdnfP21237 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
BdnfP21237 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
BdnfP21237 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
BdnfP21237 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
BdnfP21237 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
BdnfP21237 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
BdnfP21237 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
BdnfP21237 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
BdnfP21237 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
BdnfP21237 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
BdnfP21237 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
BdnfP21237 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
BdnfP21237 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
BdnfP21237 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
BdnfP21237 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.47
BdnfP21237 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
BdnfP21237 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
BdnfP21237 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
BdnfP21237 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
BdnfP21237 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
BdnfP21237 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
BdnfP21237 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
BdnfP21237 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
BdnfP21237 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
BdnfP21237 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
BdnfP21237 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
BdnfP21237 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
BdnfP21237 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
BdnfP21237 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
BdnfP21237 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
BdnfP21237 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
BdnfP21237 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
BdnfP21237 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
BdnfP21237 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
BdnfP21237 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
BdnfP21237 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
BdnfP21237 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
BdnfP21237 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
BdnfP21237 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
BdnfP21237 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
BdnfP21237 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
BdnfP21237 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
BdnfP21237 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
BdnfP21237 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
BdnfP21237 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
BdnfP21237 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
BdnfP21237 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
BdnfP21237 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
BdnfP21237 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
BdnfP21237 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
BdnfP21237 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
BdnfP21237 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
BdnfP21237 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
BdnfP21237 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
BdnfP21237 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
BdnfP21237 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
BdnfP21237 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
BdnfP21237 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
BdnfP21237 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
BdnfP21237 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
BdnfP21237 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
BdnfP21237 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
BdnfP21237 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
BdnfP21237 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
BdnfP21237 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
BdnfP21237 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
BdnfP21237 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
BdnfP21237 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
BdnfP21237 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
BdnfP21237 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
BdnfP21237 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
BdnfP21237 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
BdnfP21237 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
BdnfP21237 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
BdnfP21237 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
BdnfP21237 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
BdnfP21237 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
BdnfP21237 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
BdnfP21237 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
BdnfP21237 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
BdnfP21237 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
BdnfP21237 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
BdnfP21237 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
BdnfP21237 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
BdnfP21237 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
BdnfP21237 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
BdnfP21237 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms