Protein–RNA interactions for Protein: P17563

Selenbp1, Selenium-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 472 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Selenbp1P17563 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Selenbp1P17563 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Selenbp1P17563 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Selenbp1P17563 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Selenbp1P17563 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Selenbp1P17563 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Selenbp1P17563 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Selenbp1P17563 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Selenbp1P17563 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Selenbp1P17563 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Selenbp1P17563 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Selenbp1P17563 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Selenbp1P17563 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Selenbp1P17563 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Selenbp1P17563 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Selenbp1P17563 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Selenbp1P17563 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Selenbp1P17563 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Selenbp1P17563 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Selenbp1P17563 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Selenbp1P17563 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Selenbp1P17563 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Selenbp1P17563 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Selenbp1P17563 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Selenbp1P17563 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Selenbp1P17563 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Selenbp1P17563 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Selenbp1P17563 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Selenbp1P17563 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Selenbp1P17563 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Selenbp1P17563 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Selenbp1P17563 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Selenbp1P17563 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Selenbp1P17563 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Selenbp1P17563 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Selenbp1P17563 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Selenbp1P17563 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Selenbp1P17563 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Selenbp1P17563 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Selenbp1P17563 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Selenbp1P17563 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Selenbp1P17563 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Selenbp1P17563 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Selenbp1P17563 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Selenbp1P17563 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Selenbp1P17563 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Selenbp1P17563 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Selenbp1P17563 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Selenbp1P17563 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Selenbp1P17563 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Selenbp1P17563 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Selenbp1P17563 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Selenbp1P17563 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Selenbp1P17563 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Selenbp1P17563 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Selenbp1P17563 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Selenbp1P17563 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Selenbp1P17563 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Selenbp1P17563 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Selenbp1P17563 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Selenbp1P17563 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Selenbp1P17563 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Selenbp1P17563 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Selenbp1P17563 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Selenbp1P17563 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Selenbp1P17563 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Selenbp1P17563 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Selenbp1P17563 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Selenbp1P17563 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Selenbp1P17563 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Selenbp1P17563 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Selenbp1P17563 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Selenbp1P17563 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Selenbp1P17563 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Selenbp1P17563 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Selenbp1P17563 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Selenbp1P17563 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Selenbp1P17563 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Selenbp1P17563 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Selenbp1P17563 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Selenbp1P17563 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Selenbp1P17563 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Selenbp1P17563 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Selenbp1P17563 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Selenbp1P17563 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Selenbp1P17563 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Selenbp1P17563 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Selenbp1P17563 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Selenbp1P17563 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Selenbp1P17563 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Selenbp1P17563 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Selenbp1P17563 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Selenbp1P17563 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Selenbp1P17563 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Selenbp1P17563 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Selenbp1P17563 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Selenbp1P17563 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Selenbp1P17563 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Selenbp1P17563 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Selenbp1P17563 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms