Protein–RNA interactions for Protein: P17208

Pou4f1, POU domain, class 4, transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 421 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou4f1P17208 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pou4f1P17208 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Pou4f1P17208 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pou4f1P17208 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pou4f1P17208 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pou4f1P17208 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pou4f1P17208 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pou4f1P17208 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pou4f1P17208 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pou4f1P17208 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pou4f1P17208 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pou4f1P17208 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pou4f1P17208 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pou4f1P17208 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pou4f1P17208 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pou4f1P17208 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pou4f1P17208 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pou4f1P17208 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pou4f1P17208 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pou4f1P17208 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pou4f1P17208 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pou4f1P17208 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pou4f1P17208 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pou4f1P17208 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pou4f1P17208 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pou4f1P17208 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pou4f1P17208 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pou4f1P17208 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pou4f1P17208 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pou4f1P17208 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pou4f1P17208 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pou4f1P17208 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Pou4f1P17208 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pou4f1P17208 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pou4f1P17208 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pou4f1P17208 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pou4f1P17208 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pou4f1P17208 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pou4f1P17208 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pou4f1P17208 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pou4f1P17208 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pou4f1P17208 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pou4f1P17208 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pou4f1P17208 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pou4f1P17208 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pou4f1P17208 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pou4f1P17208 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pou4f1P17208 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pou4f1P17208 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pou4f1P17208 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pou4f1P17208 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pou4f1P17208 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pou4f1P17208 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pou4f1P17208 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pou4f1P17208 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pou4f1P17208 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pou4f1P17208 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pou4f1P17208 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pou4f1P17208 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pou4f1P17208 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pou4f1P17208 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pou4f1P17208 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pou4f1P17208 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pou4f1P17208 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pou4f1P17208 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pou4f1P17208 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pou4f1P17208 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pou4f1P17208 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pou4f1P17208 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pou4f1P17208 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pou4f1P17208 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Pou4f1P17208 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pou4f1P17208 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pou4f1P17208 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pou4f1P17208 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pou4f1P17208 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pou4f1P17208 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pou4f1P17208 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Pou4f1P17208 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Pou4f1P17208 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pou4f1P17208 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pou4f1P17208 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pou4f1P17208 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pou4f1P17208 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pou4f1P17208 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Pou4f1P17208 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pou4f1P17208 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pou4f1P17208 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pou4f1P17208 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pou4f1P17208 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pou4f1P17208 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pou4f1P17208 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pou4f1P17208 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pou4f1P17208 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pou4f1P17208 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pou4f1P17208 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pou4f1P17208 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Pou4f1P17208 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pou4f1P17208 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pou4f1P17208 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms