Protein–RNA interactions for Protein: P15331

Prph, Peripherin, mousemouse

Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrphP15331 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PrphP15331 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PrphP15331 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PrphP15331 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PrphP15331 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PrphP15331 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PrphP15331 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PrphP15331 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PrphP15331 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PrphP15331 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PrphP15331 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PrphP15331 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PrphP15331 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PrphP15331 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PrphP15331 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PrphP15331 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PrphP15331 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PrphP15331 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PrphP15331 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PrphP15331 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PrphP15331 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PrphP15331 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PrphP15331 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PrphP15331 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PrphP15331 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PrphP15331 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PrphP15331 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PrphP15331 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PrphP15331 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PrphP15331 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PrphP15331 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PrphP15331 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PrphP15331 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PrphP15331 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PrphP15331 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
PrphP15331 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PrphP15331 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PrphP15331 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PrphP15331 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PrphP15331 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PrphP15331 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PrphP15331 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PrphP15331 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PrphP15331 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PrphP15331 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PrphP15331 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PrphP15331 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PrphP15331 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PrphP15331 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PrphP15331 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PrphP15331 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PrphP15331 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PrphP15331 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PrphP15331 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PrphP15331 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PrphP15331 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PrphP15331 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PrphP15331 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PrphP15331 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PrphP15331 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PrphP15331 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PrphP15331 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PrphP15331 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PrphP15331 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PrphP15331 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PrphP15331 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PrphP15331 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PrphP15331 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PrphP15331 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PrphP15331 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PrphP15331 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
PrphP15331 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PrphP15331 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PrphP15331 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PrphP15331 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PrphP15331 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PrphP15331 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PrphP15331 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PrphP15331 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PrphP15331 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PrphP15331 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PrphP15331 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PrphP15331 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PrphP15331 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PrphP15331 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
PrphP15331 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PrphP15331 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PrphP15331 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PrphP15331 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PrphP15331 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PrphP15331 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PrphP15331 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PrphP15331 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PrphP15331 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PrphP15331 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PrphP15331 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PrphP15331 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PrphP15331 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PrphP15331 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PrphP15331 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms