Protein–RNA interactions for Protein: P13864

Dnmt1, DNA (cytosine-5)-methyltransferase 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnmt1P13864 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Dnmt1P13864 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC29.41■■■□□ 2.3
Dnmt1P13864 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Dnmt1P13864 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Dnmt1P13864 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC29.4■■■□□ 2.3
Dnmt1P13864 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Dnmt1P13864 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Dnmt1P13864 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.4■■■□□ 2.3
Dnmt1P13864 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
Dnmt1P13864 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Dnmt1P13864 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Dnmt1P13864 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
Dnmt1P13864 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
Dnmt1P13864 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
Dnmt1P13864 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Dnmt1P13864 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Dnmt1P13864 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Dnmt1P13864 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
Dnmt1P13864 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Dnmt1P13864 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Dnmt1P13864 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Dnmt1P13864 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.38■■■□□ 2.29
Dnmt1P13864 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Dnmt1P13864 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Dnmt1P13864 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC29.37■■■□□ 2.29
Dnmt1P13864 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Dnmt1P13864 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Dnmt1P13864 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Dnmt1P13864 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Dnmt1P13864 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Dnmt1P13864 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Dnmt1P13864 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Dnmt1P13864 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
Dnmt1P13864 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Dnmt1P13864 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Dnmt1P13864 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Dnmt1P13864 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Dnmt1P13864 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Dnmt1P13864 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Dnmt1P13864 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Dnmt1P13864 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Dnmt1P13864 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Dnmt1P13864 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Dnmt1P13864 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
Dnmt1P13864 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
Dnmt1P13864 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Dnmt1P13864 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Dnmt1P13864 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
Dnmt1P13864 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
Dnmt1P13864 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
Dnmt1P13864 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Dnmt1P13864 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC29.33■■■□□ 2.29
Dnmt1P13864 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Dnmt1P13864 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
Dnmt1P13864 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
Dnmt1P13864 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Dnmt1P13864 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Dnmt1P13864 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
Dnmt1P13864 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Dnmt1P13864 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Dnmt1P13864 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Dnmt1P13864 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Dnmt1P13864 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Dnmt1P13864 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Dnmt1P13864 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
Dnmt1P13864 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Dnmt1P13864 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Dnmt1P13864 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Dnmt1P13864 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Dnmt1P13864 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
Dnmt1P13864 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
Dnmt1P13864 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Dnmt1P13864 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Dnmt1P13864 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
Dnmt1P13864 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Dnmt1P13864 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Dnmt1P13864 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
Dnmt1P13864 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Dnmt1P13864 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Dnmt1P13864 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC29.31■■■□□ 2.28
Dnmt1P13864 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Dnmt1P13864 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Dnmt1P13864 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Dnmt1P13864 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
Dnmt1P13864 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Dnmt1P13864 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
Dnmt1P13864 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Dnmt1P13864 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Dnmt1P13864 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Dnmt1P13864 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Dnmt1P13864 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Dnmt1P13864 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
Dnmt1P13864 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
Dnmt1P13864 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Dnmt1P13864 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
Dnmt1P13864 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Dnmt1P13864 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Dnmt1P13864 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Dnmt1P13864 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Dnmt1P13864 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms