Protein–RNA interactions for Protein: P12658

Calb1, Calbindin, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Calb1P12658 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Calb1P12658 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Calb1P12658 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Calb1P12658 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Calb1P12658 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Calb1P12658 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Calb1P12658 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Calb1P12658 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Calb1P12658 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Calb1P12658 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Calb1P12658 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Calb1P12658 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Calb1P12658 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Calb1P12658 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Calb1P12658 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Calb1P12658 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Calb1P12658 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Calb1P12658 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Calb1P12658 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Calb1P12658 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Calb1P12658 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Calb1P12658 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Calb1P12658 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Calb1P12658 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Calb1P12658 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Calb1P12658 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Calb1P12658 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Calb1P12658 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Calb1P12658 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Calb1P12658 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Calb1P12658 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Calb1P12658 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Calb1P12658 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Calb1P12658 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Calb1P12658 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Calb1P12658 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Calb1P12658 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Calb1P12658 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Calb1P12658 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Calb1P12658 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Calb1P12658 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Calb1P12658 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Calb1P12658 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Calb1P12658 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Calb1P12658 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Calb1P12658 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Calb1P12658 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Calb1P12658 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Calb1P12658 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Calb1P12658 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Calb1P12658 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Calb1P12658 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Calb1P12658 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Calb1P12658 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Calb1P12658 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Calb1P12658 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Calb1P12658 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Calb1P12658 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Calb1P12658 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Calb1P12658 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Calb1P12658 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Calb1P12658 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Calb1P12658 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Calb1P12658 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Calb1P12658 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Calb1P12658 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Calb1P12658 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Calb1P12658 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Calb1P12658 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Calb1P12658 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Calb1P12658 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Calb1P12658 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Calb1P12658 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Calb1P12658 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Calb1P12658 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Calb1P12658 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Calb1P12658 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Calb1P12658 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Calb1P12658 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Calb1P12658 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Calb1P12658 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Calb1P12658 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Calb1P12658 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Calb1P12658 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Calb1P12658 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Calb1P12658 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Calb1P12658 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Calb1P12658 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Calb1P12658 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Calb1P12658 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Calb1P12658 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Calb1P12658 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Calb1P12658 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Calb1P12658 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Calb1P12658 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Calb1P12658 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Calb1P12658 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Calb1P12658 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Calb1P12658 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Calb1P12658 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms