Protein–RNA interactions for Protein: P11438

Lamp1, Lysosome-associated membrane glycoprotein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 406 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lamp1P11438 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Lamp1P11438 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Lamp1P11438 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Lamp1P11438 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Lamp1P11438 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Lamp1P11438 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Lamp1P11438 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Lamp1P11438 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Lamp1P11438 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Lamp1P11438 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Lamp1P11438 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Lamp1P11438 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Lamp1P11438 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Lamp1P11438 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Lamp1P11438 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Lamp1P11438 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Lamp1P11438 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Lamp1P11438 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Lamp1P11438 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Lamp1P11438 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Lamp1P11438 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Lamp1P11438 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Lamp1P11438 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Lamp1P11438 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Lamp1P11438 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Lamp1P11438 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Lamp1P11438 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Lamp1P11438 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Lamp1P11438 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Lamp1P11438 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Lamp1P11438 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Lamp1P11438 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Lamp1P11438 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Lamp1P11438 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Lamp1P11438 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Lamp1P11438 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Lamp1P11438 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Lamp1P11438 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Lamp1P11438 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Lamp1P11438 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Lamp1P11438 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Lamp1P11438 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Lamp1P11438 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Lamp1P11438 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Lamp1P11438 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Lamp1P11438 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Lamp1P11438 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Lamp1P11438 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Lamp1P11438 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Lamp1P11438 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Lamp1P11438 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Lamp1P11438 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Lamp1P11438 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Lamp1P11438 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Lamp1P11438 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Lamp1P11438 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Lamp1P11438 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Lamp1P11438 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Lamp1P11438 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Lamp1P11438 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Lamp1P11438 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Lamp1P11438 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Lamp1P11438 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Lamp1P11438 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Lamp1P11438 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Lamp1P11438 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Lamp1P11438 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Lamp1P11438 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Lamp1P11438 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Lamp1P11438 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Lamp1P11438 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Lamp1P11438 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Lamp1P11438 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Lamp1P11438 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Lamp1P11438 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Lamp1P11438 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Lamp1P11438 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Lamp1P11438 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Lamp1P11438 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Lamp1P11438 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Lamp1P11438 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Lamp1P11438 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Lamp1P11438 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Lamp1P11438 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Lamp1P11438 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Lamp1P11438 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Lamp1P11438 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Lamp1P11438 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC21.27■□□□□ 0.99
Lamp1P11438 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Lamp1P11438 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Lamp1P11438 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Lamp1P11438 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Lamp1P11438 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Lamp1P11438 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Lamp1P11438 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Lamp1P11438 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Lamp1P11438 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Lamp1P11438 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Lamp1P11438 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Lamp1P11438 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms