Protein–RNA interactions for Protein: P08553

Nefm, Neurofilament medium polypeptide, mousemouse

Predictions only

Length 848 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NefmP08553 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
NefmP08553 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
NefmP08553 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
NefmP08553 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
NefmP08553 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
NefmP08553 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
NefmP08553 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
NefmP08553 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
NefmP08553 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
NefmP08553 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
NefmP08553 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
NefmP08553 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
NefmP08553 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
NefmP08553 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
NefmP08553 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
NefmP08553 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
NefmP08553 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
NefmP08553 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
NefmP08553 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
NefmP08553 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
NefmP08553 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
NefmP08553 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
NefmP08553 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
NefmP08553 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
NefmP08553 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
NefmP08553 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
NefmP08553 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
NefmP08553 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
NefmP08553 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
NefmP08553 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
NefmP08553 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
NefmP08553 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
NefmP08553 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
NefmP08553 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
NefmP08553 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
NefmP08553 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
NefmP08553 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
NefmP08553 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
NefmP08553 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
NefmP08553 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
NefmP08553 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
NefmP08553 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
NefmP08553 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
NefmP08553 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
NefmP08553 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
NefmP08553 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
NefmP08553 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
NefmP08553 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
NefmP08553 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
NefmP08553 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
NefmP08553 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
NefmP08553 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
NefmP08553 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC27.84■■■□□ 2.05
NefmP08553 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
NefmP08553 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
NefmP08553 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
NefmP08553 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
NefmP08553 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
NefmP08553 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
NefmP08553 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
NefmP08553 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC27.83■■■□□ 2.05
NefmP08553 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
NefmP08553 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
NefmP08553 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
NefmP08553 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
NefmP08553 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
NefmP08553 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
NefmP08553 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.04
NefmP08553 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
NefmP08553 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
NefmP08553 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
NefmP08553 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
NefmP08553 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
NefmP08553 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
NefmP08553 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
NefmP08553 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
NefmP08553 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
NefmP08553 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
NefmP08553 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
NefmP08553 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
NefmP08553 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
NefmP08553 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
NefmP08553 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
NefmP08553 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
NefmP08553 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
NefmP08553 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
NefmP08553 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
NefmP08553 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
NefmP08553 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
NefmP08553 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
NefmP08553 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
NefmP08553 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
NefmP08553 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
NefmP08553 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
NefmP08553 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
NefmP08553 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
NefmP08553 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
NefmP08553 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
NefmP08553 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
NefmP08553 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms