Protein–RNA interactions for Protein: P04213

T-cell receptor beta chain V region C5 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 122 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P04213 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
P04213 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
P04213 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
P04213 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
P04213 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
P04213 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
P04213 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
P04213 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
P04213 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
P04213 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
P04213 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
P04213 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
P04213 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
P04213 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
P04213 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
P04213 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
P04213 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
P04213 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
P04213 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
P04213 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
P04213 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
P04213 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
P04213 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
P04213 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
P04213 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
P04213 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
P04213 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
P04213 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
P04213 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
P04213 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
P04213 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
P04213 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
P04213 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
P04213 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
P04213 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
P04213 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
P04213 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
P04213 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
P04213 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
P04213 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
P04213 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
P04213 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
P04213 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
P04213 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
P04213 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
P04213 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
P04213 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
P04213 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
P04213 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
P04213 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
P04213 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
P04213 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
P04213 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
P04213 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
P04213 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
P04213 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
P04213 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
P04213 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
P04213 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
P04213 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
P04213 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
P04213 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
P04213 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
P04213 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
P04213 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
P04213 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
P04213 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
P04213 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
P04213 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
P04213 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
P04213 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
P04213 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
P04213 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
P04213 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
P04213 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
P04213 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
P04213 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
P04213 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
P04213 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
P04213 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
P04213 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
P04213 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
P04213 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
P04213 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
P04213 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
P04213 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
P04213 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
P04213 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
P04213 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
P04213 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
P04213 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
P04213 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
P04213 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
P04213 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
P04213 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
P04213 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
P04213 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
P04213 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
P04213 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
P04213 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms