Protein–RNA interactions for Protein: O89012

Magea8, MCG115467, mousemouse

Predictions only

Length 320 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Magea8O89012 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Magea8O89012 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Magea8O89012 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Magea8O89012 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Magea8O89012 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Magea8O89012 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Magea8O89012 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Magea8O89012 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Magea8O89012 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Magea8O89012 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Magea8O89012 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Magea8O89012 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Magea8O89012 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Magea8O89012 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Magea8O89012 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Magea8O89012 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Magea8O89012 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Magea8O89012 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Magea8O89012 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Magea8O89012 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Magea8O89012 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Magea8O89012 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Magea8O89012 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Magea8O89012 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Magea8O89012 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Magea8O89012 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Magea8O89012 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Magea8O89012 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Magea8O89012 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Magea8O89012 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Magea8O89012 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Magea8O89012 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Magea8O89012 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Magea8O89012 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Magea8O89012 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Magea8O89012 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Magea8O89012 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Magea8O89012 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Magea8O89012 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Magea8O89012 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Magea8O89012 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Magea8O89012 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Magea8O89012 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Magea8O89012 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Magea8O89012 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Magea8O89012 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Magea8O89012 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Magea8O89012 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Magea8O89012 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Magea8O89012 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Magea8O89012 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Magea8O89012 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Magea8O89012 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Magea8O89012 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Magea8O89012 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Magea8O89012 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Magea8O89012 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Magea8O89012 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Magea8O89012 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Magea8O89012 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Magea8O89012 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Magea8O89012 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Magea8O89012 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Magea8O89012 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Magea8O89012 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Magea8O89012 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Magea8O89012 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Magea8O89012 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Magea8O89012 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Magea8O89012 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Magea8O89012 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Magea8O89012 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Magea8O89012 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Magea8O89012 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Magea8O89012 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Magea8O89012 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Magea8O89012 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Magea8O89012 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Magea8O89012 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Magea8O89012 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Magea8O89012 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Magea8O89012 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Magea8O89012 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Magea8O89012 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Magea8O89012 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Magea8O89012 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Magea8O89012 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Magea8O89012 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Magea8O89012 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Magea8O89012 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Magea8O89012 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Magea8O89012 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Magea8O89012 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Magea8O89012 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Magea8O89012 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Magea8O89012 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Magea8O89012 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Magea8O89012 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Magea8O89012 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Magea8O89012 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms