Protein–RNA interactions for Protein: O55226

Chad, Chondroadherin, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChadO55226 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
ChadO55226 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ChadO55226 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ChadO55226 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ChadO55226 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ChadO55226 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ChadO55226 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ChadO55226 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ChadO55226 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ChadO55226 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ChadO55226 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ChadO55226 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ChadO55226 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ChadO55226 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ChadO55226 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
ChadO55226 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
ChadO55226 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ChadO55226 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ChadO55226 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ChadO55226 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ChadO55226 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ChadO55226 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ChadO55226 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ChadO55226 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ChadO55226 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ChadO55226 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ChadO55226 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ChadO55226 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ChadO55226 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ChadO55226 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
ChadO55226 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
ChadO55226 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
ChadO55226 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ChadO55226 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
ChadO55226 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ChadO55226 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ChadO55226 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ChadO55226 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
ChadO55226 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
ChadO55226 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ChadO55226 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ChadO55226 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ChadO55226 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ChadO55226 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ChadO55226 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ChadO55226 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ChadO55226 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ChadO55226 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ChadO55226 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ChadO55226 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
ChadO55226 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ChadO55226 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
ChadO55226 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ChadO55226 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ChadO55226 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ChadO55226 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ChadO55226 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ChadO55226 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ChadO55226 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ChadO55226 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ChadO55226 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ChadO55226 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ChadO55226 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ChadO55226 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ChadO55226 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ChadO55226 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ChadO55226 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ChadO55226 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ChadO55226 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ChadO55226 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ChadO55226 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ChadO55226 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ChadO55226 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
ChadO55226 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ChadO55226 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ChadO55226 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ChadO55226 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ChadO55226 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ChadO55226 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ChadO55226 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ChadO55226 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ChadO55226 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ChadO55226 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ChadO55226 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ChadO55226 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ChadO55226 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ChadO55226 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ChadO55226 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ChadO55226 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ChadO55226 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ChadO55226 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ChadO55226 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ChadO55226 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ChadO55226 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ChadO55226 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ChadO55226 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ChadO55226 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ChadO55226 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ChadO55226 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ChadO55226 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms