Protein–RNA interactions for Protein: O55225

Otog, Otogelin, mousemouse

Predictions only

Length 2,910 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OtogO55225 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
OtogO55225 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
OtogO55225 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
OtogO55225 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
OtogO55225 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
OtogO55225 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
OtogO55225 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
OtogO55225 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
OtogO55225 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
OtogO55225 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
OtogO55225 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
OtogO55225 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
OtogO55225 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
OtogO55225 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
OtogO55225 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
OtogO55225 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
OtogO55225 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
OtogO55225 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
OtogO55225 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
OtogO55225 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
OtogO55225 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
OtogO55225 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
OtogO55225 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
OtogO55225 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
OtogO55225 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
OtogO55225 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
OtogO55225 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
OtogO55225 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
OtogO55225 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
OtogO55225 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
OtogO55225 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
OtogO55225 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
OtogO55225 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
OtogO55225 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
OtogO55225 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
OtogO55225 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
OtogO55225 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
OtogO55225 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
OtogO55225 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
OtogO55225 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
OtogO55225 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
OtogO55225 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
OtogO55225 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
OtogO55225 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
OtogO55225 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
OtogO55225 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
OtogO55225 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
OtogO55225 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
OtogO55225 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
OtogO55225 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
OtogO55225 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
OtogO55225 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
OtogO55225 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
OtogO55225 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
OtogO55225 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
OtogO55225 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
OtogO55225 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
OtogO55225 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
OtogO55225 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
OtogO55225 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
OtogO55225 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
OtogO55225 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
OtogO55225 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
OtogO55225 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
OtogO55225 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
OtogO55225 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
OtogO55225 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
OtogO55225 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
OtogO55225 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
OtogO55225 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.05
OtogO55225 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
OtogO55225 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
OtogO55225 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
OtogO55225 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
OtogO55225 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
OtogO55225 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
OtogO55225 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
OtogO55225 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
OtogO55225 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
OtogO55225 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
OtogO55225 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
OtogO55225 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
OtogO55225 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
OtogO55225 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
OtogO55225 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
OtogO55225 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
OtogO55225 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
OtogO55225 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
OtogO55225 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
OtogO55225 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
OtogO55225 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
OtogO55225 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
OtogO55225 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
OtogO55225 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
OtogO55225 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
OtogO55225 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
OtogO55225 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
OtogO55225 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
OtogO55225 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
OtogO55225 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms