Protein–RNA interactions for Protein: O55100

Syngr1, Synaptogyrin-1, mousemouse

Predictions only

Length 234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syngr1O55100 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Syngr1O55100 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Syngr1O55100 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
Syngr1O55100 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Syngr1O55100 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Syngr1O55100 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
Syngr1O55100 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
Syngr1O55100 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Syngr1O55100 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Syngr1O55100 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
Syngr1O55100 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
Syngr1O55100 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Syngr1O55100 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Syngr1O55100 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Syngr1O55100 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Syngr1O55100 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Syngr1O55100 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Syngr1O55100 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
Syngr1O55100 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Syngr1O55100 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Syngr1O55100 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Syngr1O55100 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Syngr1O55100 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Syngr1O55100 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Syngr1O55100 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Syngr1O55100 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Syngr1O55100 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Syngr1O55100 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Syngr1O55100 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Syngr1O55100 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Syngr1O55100 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Syngr1O55100 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Syngr1O55100 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Syngr1O55100 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Syngr1O55100 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Syngr1O55100 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Syngr1O55100 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Syngr1O55100 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Syngr1O55100 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Syngr1O55100 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Syngr1O55100 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Syngr1O55100 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Syngr1O55100 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Syngr1O55100 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Syngr1O55100 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Syngr1O55100 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Syngr1O55100 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Syngr1O55100 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Syngr1O55100 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Syngr1O55100 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Syngr1O55100 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Syngr1O55100 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Syngr1O55100 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Syngr1O55100 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Syngr1O55100 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Syngr1O55100 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Syngr1O55100 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Syngr1O55100 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Syngr1O55100 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Syngr1O55100 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Syngr1O55100 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Syngr1O55100 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Syngr1O55100 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Syngr1O55100 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Syngr1O55100 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Syngr1O55100 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Syngr1O55100 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Syngr1O55100 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Syngr1O55100 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Syngr1O55100 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Syngr1O55100 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Syngr1O55100 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Syngr1O55100 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.59
Syngr1O55100 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Syngr1O55100 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Syngr1O55100 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Syngr1O55100 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Syngr1O55100 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Syngr1O55100 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Syngr1O55100 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Syngr1O55100 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Syngr1O55100 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Syngr1O55100 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Syngr1O55100 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Syngr1O55100 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Syngr1O55100 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Syngr1O55100 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Syngr1O55100 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Syngr1O55100 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Syngr1O55100 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Syngr1O55100 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Syngr1O55100 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Syngr1O55100 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Syngr1O55100 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Syngr1O55100 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Syngr1O55100 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Syngr1O55100 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Syngr1O55100 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Syngr1O55100 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Syngr1O55100 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms