Protein–RNA interactions for Protein: O54827

Atp10a, Probable phospholipid-transporting ATPase VA, mousemouse

Predictions only

Length 1,508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp10aO54827 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
Atp10aO54827 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Atp10aO54827 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Atp10aO54827 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Atp10aO54827 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Atp10aO54827 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Atp10aO54827 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Atp10aO54827 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Atp10aO54827 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Atp10aO54827 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Atp10aO54827 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Atp10aO54827 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Atp10aO54827 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Atp10aO54827 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Atp10aO54827 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Atp10aO54827 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Atp10aO54827 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Atp10aO54827 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
Atp10aO54827 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Atp10aO54827 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Atp10aO54827 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Atp10aO54827 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Atp10aO54827 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Atp10aO54827 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Atp10aO54827 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Atp10aO54827 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Atp10aO54827 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Atp10aO54827 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Atp10aO54827 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Atp10aO54827 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
Atp10aO54827 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Atp10aO54827 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Atp10aO54827 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Atp10aO54827 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Atp10aO54827 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Atp10aO54827 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
Atp10aO54827 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Atp10aO54827 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Atp10aO54827 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Atp10aO54827 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Atp10aO54827 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Atp10aO54827 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Atp10aO54827 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Atp10aO54827 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Atp10aO54827 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Atp10aO54827 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Atp10aO54827 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Atp10aO54827 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Atp10aO54827 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Atp10aO54827 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Atp10aO54827 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Atp10aO54827 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
Atp10aO54827 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Atp10aO54827 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Atp10aO54827 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Atp10aO54827 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
Atp10aO54827 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Atp10aO54827 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Atp10aO54827 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Atp10aO54827 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Atp10aO54827 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Atp10aO54827 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
Atp10aO54827 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Atp10aO54827 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Atp10aO54827 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Atp10aO54827 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Atp10aO54827 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Atp10aO54827 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Atp10aO54827 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Atp10aO54827 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Atp10aO54827 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Atp10aO54827 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Atp10aO54827 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
Atp10aO54827 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
Atp10aO54827 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Atp10aO54827 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Atp10aO54827 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
Atp10aO54827 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Atp10aO54827 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Atp10aO54827 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Atp10aO54827 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Atp10aO54827 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Atp10aO54827 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Atp10aO54827 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
Atp10aO54827 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
Atp10aO54827 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
Atp10aO54827 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
Atp10aO54827 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
Atp10aO54827 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Atp10aO54827 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Atp10aO54827 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Atp10aO54827 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Atp10aO54827 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Atp10aO54827 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
Atp10aO54827 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
Atp10aO54827 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Atp10aO54827 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Atp10aO54827 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
Atp10aO54827 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
Atp10aO54827 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms