Protein–RNA interactions for Protein: O54788

Dffb, DNA fragmentation factor subunit beta, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DffbO54788 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
DffbO54788 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
DffbO54788 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
DffbO54788 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
DffbO54788 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
DffbO54788 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
DffbO54788 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
DffbO54788 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
DffbO54788 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
DffbO54788 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
DffbO54788 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
DffbO54788 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
DffbO54788 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
DffbO54788 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
DffbO54788 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
DffbO54788 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
DffbO54788 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
DffbO54788 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
DffbO54788 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
DffbO54788 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
DffbO54788 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
DffbO54788 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
DffbO54788 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
DffbO54788 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
DffbO54788 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
DffbO54788 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
DffbO54788 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
DffbO54788 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
DffbO54788 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
DffbO54788 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
DffbO54788 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
DffbO54788 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
DffbO54788 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
DffbO54788 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
DffbO54788 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
DffbO54788 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
DffbO54788 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
DffbO54788 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
DffbO54788 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
DffbO54788 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
DffbO54788 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
DffbO54788 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
DffbO54788 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
DffbO54788 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
DffbO54788 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
DffbO54788 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
DffbO54788 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
DffbO54788 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
DffbO54788 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
DffbO54788 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
DffbO54788 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DffbO54788 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DffbO54788 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DffbO54788 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
DffbO54788 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DffbO54788 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
DffbO54788 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
DffbO54788 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DffbO54788 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DffbO54788 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
DffbO54788 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DffbO54788 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DffbO54788 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DffbO54788 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
DffbO54788 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DffbO54788 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DffbO54788 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DffbO54788 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
DffbO54788 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DffbO54788 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DffbO54788 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
DffbO54788 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DffbO54788 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
DffbO54788 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DffbO54788 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DffbO54788 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
DffbO54788 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DffbO54788 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
DffbO54788 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
DffbO54788 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
DffbO54788 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
DffbO54788 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
DffbO54788 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
DffbO54788 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
DffbO54788 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
DffbO54788 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
DffbO54788 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
DffbO54788 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
DffbO54788 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
DffbO54788 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
DffbO54788 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
DffbO54788 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
DffbO54788 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
DffbO54788 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
DffbO54788 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
DffbO54788 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
DffbO54788 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
DffbO54788 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
DffbO54788 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
DffbO54788 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms