Protein–RNA interactions for Protein: O35493

Clk4, Dual specificity protein kinase CLK4, mousemouse

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clk4O35493 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Clk4O35493 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Clk4O35493 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Clk4O35493 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Clk4O35493 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Clk4O35493 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Clk4O35493 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Clk4O35493 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Clk4O35493 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Clk4O35493 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Clk4O35493 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Clk4O35493 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Clk4O35493 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Clk4O35493 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Clk4O35493 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Clk4O35493 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Clk4O35493 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Clk4O35493 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Clk4O35493 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Clk4O35493 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Clk4O35493 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Clk4O35493 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Clk4O35493 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Clk4O35493 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Clk4O35493 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Clk4O35493 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Clk4O35493 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Clk4O35493 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Clk4O35493 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Clk4O35493 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Clk4O35493 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Clk4O35493 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Clk4O35493 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Clk4O35493 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Clk4O35493 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Clk4O35493 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Clk4O35493 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Clk4O35493 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Clk4O35493 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Clk4O35493 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Clk4O35493 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Clk4O35493 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Clk4O35493 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Clk4O35493 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Clk4O35493 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Clk4O35493 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Clk4O35493 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Clk4O35493 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Clk4O35493 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Clk4O35493 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
Clk4O35493 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Clk4O35493 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Clk4O35493 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Clk4O35493 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Clk4O35493 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Clk4O35493 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Clk4O35493 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Clk4O35493 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Clk4O35493 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Clk4O35493 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Clk4O35493 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Clk4O35493 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Clk4O35493 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Clk4O35493 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Clk4O35493 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Clk4O35493 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Clk4O35493 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Clk4O35493 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Clk4O35493 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Clk4O35493 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Clk4O35493 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Clk4O35493 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Clk4O35493 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Clk4O35493 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Clk4O35493 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Clk4O35493 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Clk4O35493 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Clk4O35493 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Clk4O35493 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Clk4O35493 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Clk4O35493 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Clk4O35493 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Clk4O35493 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Clk4O35493 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Clk4O35493 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Clk4O35493 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Clk4O35493 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Clk4O35493 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Clk4O35493 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Clk4O35493 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Clk4O35493 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Clk4O35493 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Clk4O35493 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Clk4O35493 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Clk4O35493 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Clk4O35493 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Clk4O35493 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Clk4O35493 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Clk4O35493 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Clk4O35493 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.5 ms