Protein–RNA interactions for Protein: O08574

Mesp2, Mesoderm posterior protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 370 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mesp2O08574 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Mesp2O08574 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Mesp2O08574 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mesp2O08574 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mesp2O08574 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mesp2O08574 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Mesp2O08574 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mesp2O08574 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mesp2O08574 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mesp2O08574 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mesp2O08574 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mesp2O08574 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Mesp2O08574 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mesp2O08574 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mesp2O08574 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mesp2O08574 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mesp2O08574 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mesp2O08574 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mesp2O08574 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mesp2O08574 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mesp2O08574 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mesp2O08574 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mesp2O08574 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mesp2O08574 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mesp2O08574 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mesp2O08574 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mesp2O08574 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mesp2O08574 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mesp2O08574 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mesp2O08574 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mesp2O08574 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mesp2O08574 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Mesp2O08574 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mesp2O08574 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mesp2O08574 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mesp2O08574 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mesp2O08574 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mesp2O08574 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Mesp2O08574 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mesp2O08574 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mesp2O08574 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mesp2O08574 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mesp2O08574 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mesp2O08574 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mesp2O08574 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mesp2O08574 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mesp2O08574 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Mesp2O08574 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mesp2O08574 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mesp2O08574 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mesp2O08574 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mesp2O08574 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mesp2O08574 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mesp2O08574 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mesp2O08574 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mesp2O08574 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mesp2O08574 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mesp2O08574 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mesp2O08574 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mesp2O08574 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mesp2O08574 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mesp2O08574 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mesp2O08574 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mesp2O08574 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mesp2O08574 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mesp2O08574 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Mesp2O08574 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Mesp2O08574 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mesp2O08574 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mesp2O08574 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mesp2O08574 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mesp2O08574 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mesp2O08574 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mesp2O08574 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mesp2O08574 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Mesp2O08574 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mesp2O08574 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mesp2O08574 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mesp2O08574 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mesp2O08574 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mesp2O08574 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mesp2O08574 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mesp2O08574 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mesp2O08574 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mesp2O08574 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mesp2O08574 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mesp2O08574 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mesp2O08574 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mesp2O08574 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mesp2O08574 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mesp2O08574 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mesp2O08574 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mesp2O08574 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mesp2O08574 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mesp2O08574 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mesp2O08574 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mesp2O08574 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mesp2O08574 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mesp2O08574 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mesp2O08574 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms