Protein–RNA interactions for Protein: J3QNP2

Smim18, Small integral membrane protein 18, mousemouse

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Length 93 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim18J3QNP2 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Smim18J3QNP2 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Smim18J3QNP2 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Smim18J3QNP2 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Smim18J3QNP2 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Smim18J3QNP2 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Smim18J3QNP2 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Smim18J3QNP2 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Smim18J3QNP2 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Smim18J3QNP2 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Smim18J3QNP2 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Smim18J3QNP2 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Smim18J3QNP2 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Smim18J3QNP2 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Smim18J3QNP2 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Smim18J3QNP2 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Smim18J3QNP2 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Smim18J3QNP2 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Smim18J3QNP2 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Smim18J3QNP2 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Smim18J3QNP2 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Smim18J3QNP2 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Smim18J3QNP2 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Smim18J3QNP2 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Smim18J3QNP2 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Smim18J3QNP2 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Smim18J3QNP2 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Smim18J3QNP2 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Smim18J3QNP2 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Smim18J3QNP2 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Smim18J3QNP2 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Smim18J3QNP2 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Smim18J3QNP2 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Smim18J3QNP2 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Smim18J3QNP2 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Smim18J3QNP2 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Smim18J3QNP2 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Smim18J3QNP2 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Smim18J3QNP2 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Smim18J3QNP2 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Smim18J3QNP2 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Smim18J3QNP2 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Smim18J3QNP2 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Smim18J3QNP2 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Smim18J3QNP2 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Smim18J3QNP2 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Smim18J3QNP2 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Smim18J3QNP2 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Smim18J3QNP2 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Smim18J3QNP2 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Smim18J3QNP2 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Smim18J3QNP2 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Smim18J3QNP2 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Smim18J3QNP2 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Smim18J3QNP2 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Smim18J3QNP2 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Smim18J3QNP2 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Smim18J3QNP2 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Smim18J3QNP2 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Smim18J3QNP2 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Smim18J3QNP2 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Smim18J3QNP2 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Smim18J3QNP2 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Smim18J3QNP2 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Smim18J3QNP2 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Smim18J3QNP2 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Smim18J3QNP2 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Smim18J3QNP2 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Smim18J3QNP2 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Smim18J3QNP2 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Smim18J3QNP2 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Smim18J3QNP2 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Smim18J3QNP2 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Smim18J3QNP2 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Smim18J3QNP2 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Smim18J3QNP2 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Smim18J3QNP2 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Smim18J3QNP2 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Smim18J3QNP2 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Smim18J3QNP2 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Smim18J3QNP2 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Smim18J3QNP2 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Smim18J3QNP2 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Smim18J3QNP2 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Smim18J3QNP2 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Smim18J3QNP2 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Smim18J3QNP2 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Smim18J3QNP2 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Smim18J3QNP2 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Smim18J3QNP2 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Smim18J3QNP2 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Smim18J3QNP2 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Smim18J3QNP2 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Smim18J3QNP2 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Smim18J3QNP2 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Smim18J3QNP2 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Smim18J3QNP2 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Smim18J3QNP2 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Smim18J3QNP2 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Smim18J3QNP2 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
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