Protein–RNA interactions for Protein: J3QNE4

Ccdc180, Coiled-coil domain-containing 180, mousemouse

Predictions only

Length 1,664 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc180J3QNE4 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
Ccdc180J3QNE4 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.16
Ccdc180J3QNE4 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC34.76■■■■□ 3.16
Ccdc180J3QNE4 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.16
Ccdc180J3QNE4 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC34.76■■■■□ 3.16
Ccdc180J3QNE4 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC34.76■■■■□ 3.16
Ccdc180J3QNE4 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.16
Ccdc180J3QNE4 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.15
Ccdc180J3QNE4 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.76■■■■□ 3.15
Ccdc180J3QNE4 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC34.76■■■■□ 3.15
Ccdc180J3QNE4 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.15
Ccdc180J3QNE4 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
Ccdc180J3QNE4 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
Ccdc180J3QNE4 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
Ccdc180J3QNE4 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
Ccdc180J3QNE4 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
Ccdc180J3QNE4 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC34.75■■■■□ 3.15
Ccdc180J3QNE4 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC34.75■■■■□ 3.15
Ccdc180J3QNE4 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC34.75■■■■□ 3.15
Ccdc180J3QNE4 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
Ccdc180J3QNE4 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
Ccdc180J3QNE4 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
Ccdc180J3QNE4 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
Ccdc180J3QNE4 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
Ccdc180J3QNE4 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
Ccdc180J3QNE4 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.74■■■■□ 3.15
Ccdc180J3QNE4 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
Ccdc180J3QNE4 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.73■■■■□ 3.15
Ccdc180J3QNE4 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
Ccdc180J3QNE4 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC34.73■■■■□ 3.15
Ccdc180J3QNE4 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
Ccdc180J3QNE4 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
Ccdc180J3QNE4 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC34.73■■■■□ 3.15
Ccdc180J3QNE4 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
Ccdc180J3QNE4 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
Ccdc180J3QNE4 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
Ccdc180J3QNE4 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
Ccdc180J3QNE4 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC34.72■■■■□ 3.15
Ccdc180J3QNE4 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
Ccdc180J3QNE4 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC34.72■■■■□ 3.15
Ccdc180J3QNE4 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
Ccdc180J3QNE4 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC34.72■■■■□ 3.15
Ccdc180J3QNE4 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.71■■■■□ 3.15
Ccdc180J3QNE4 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.71■■■■□ 3.15
Ccdc180J3QNE4 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
Ccdc180J3QNE4 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
Ccdc180J3QNE4 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
Ccdc180J3QNE4 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
Ccdc180J3QNE4 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.71■■■■□ 3.15
Ccdc180J3QNE4 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC34.71■■■■□ 3.15
Ccdc180J3QNE4 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC34.7■■■■□ 3.15
Ccdc180J3QNE4 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
Ccdc180J3QNE4 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
Ccdc180J3QNE4 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
Ccdc180J3QNE4 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC34.7■■■■□ 3.15
Ccdc180J3QNE4 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
Ccdc180J3QNE4 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.14
Ccdc180J3QNE4 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.7■■■■□ 3.14
Ccdc180J3QNE4 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC34.7■■■■□ 3.14
Ccdc180J3QNE4 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
Ccdc180J3QNE4 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.69■■■■□ 3.14
Ccdc180J3QNE4 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC34.69■■■■□ 3.14
Ccdc180J3QNE4 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
Ccdc180J3QNE4 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
Ccdc180J3QNE4 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.69■■■■□ 3.14
Ccdc180J3QNE4 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
Ccdc180J3QNE4 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.68■■■■□ 3.14
Ccdc180J3QNE4 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC34.68■■■■□ 3.14
Ccdc180J3QNE4 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC34.68■■■■□ 3.14
Ccdc180J3QNE4 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
Ccdc180J3QNE4 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
Ccdc180J3QNE4 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC34.67■■■■□ 3.14
Ccdc180J3QNE4 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
Ccdc180J3QNE4 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
Ccdc180J3QNE4 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC34.66■■■■□ 3.14
Ccdc180J3QNE4 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC34.66■■■■□ 3.14
Ccdc180J3QNE4 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
Ccdc180J3QNE4 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
Ccdc180J3QNE4 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
Ccdc180J3QNE4 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
Ccdc180J3QNE4 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
Ccdc180J3QNE4 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.66■■■■□ 3.14
Ccdc180J3QNE4 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC34.66■■■■□ 3.14
Ccdc180J3QNE4 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
Ccdc180J3QNE4 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
Ccdc180J3QNE4 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC34.65■■■■□ 3.14
Ccdc180J3QNE4 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.65■■■■□ 3.14
Ccdc180J3QNE4 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
Ccdc180J3QNE4 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC34.65■■■■□ 3.14
Ccdc180J3QNE4 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
Ccdc180J3QNE4 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
Ccdc180J3QNE4 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
Ccdc180J3QNE4 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.64■■■■□ 3.14
Ccdc180J3QNE4 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
Ccdc180J3QNE4 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
Ccdc180J3QNE4 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
Ccdc180J3QNE4 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
Ccdc180J3QNE4 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC34.64■■■■□ 3.14
Ccdc180J3QNE4 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.14
Ccdc180J3QNE4 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.63■■■■□ 3.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms