Protein–RNA interactions for Protein: G5E8X2

Pabpc4l, MCG12357, mousemouse

Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pabpc4lG5E8X2 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Pabpc4lG5E8X2 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Pabpc4lG5E8X2 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Pabpc4lG5E8X2 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Pabpc4lG5E8X2 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Pabpc4lG5E8X2 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Pabpc4lG5E8X2 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Pabpc4lG5E8X2 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Pabpc4lG5E8X2 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Pabpc4lG5E8X2 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Pabpc4lG5E8X2 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Pabpc4lG5E8X2 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Pabpc4lG5E8X2 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Pabpc4lG5E8X2 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Pabpc4lG5E8X2 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Pabpc4lG5E8X2 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Pabpc4lG5E8X2 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Pabpc4lG5E8X2 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Pabpc4lG5E8X2 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Pabpc4lG5E8X2 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Pabpc4lG5E8X2 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Pabpc4lG5E8X2 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Pabpc4lG5E8X2 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Pabpc4lG5E8X2 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Pabpc4lG5E8X2 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Pabpc4lG5E8X2 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Pabpc4lG5E8X2 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Pabpc4lG5E8X2 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Pabpc4lG5E8X2 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Pabpc4lG5E8X2 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Pabpc4lG5E8X2 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Pabpc4lG5E8X2 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Pabpc4lG5E8X2 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Pabpc4lG5E8X2 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Pabpc4lG5E8X2 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Pabpc4lG5E8X2 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Pabpc4lG5E8X2 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Pabpc4lG5E8X2 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Pabpc4lG5E8X2 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Pabpc4lG5E8X2 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Pabpc4lG5E8X2 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Pabpc4lG5E8X2 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Pabpc4lG5E8X2 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Pabpc4lG5E8X2 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Pabpc4lG5E8X2 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Pabpc4lG5E8X2 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Pabpc4lG5E8X2 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Pabpc4lG5E8X2 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Pabpc4lG5E8X2 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Pabpc4lG5E8X2 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Pabpc4lG5E8X2 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Pabpc4lG5E8X2 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Pabpc4lG5E8X2 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Pabpc4lG5E8X2 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Pabpc4lG5E8X2 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Pabpc4lG5E8X2 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Pabpc4lG5E8X2 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Pabpc4lG5E8X2 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Pabpc4lG5E8X2 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Pabpc4lG5E8X2 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Pabpc4lG5E8X2 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Pabpc4lG5E8X2 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Pabpc4lG5E8X2 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Pabpc4lG5E8X2 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Pabpc4lG5E8X2 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Pabpc4lG5E8X2 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Pabpc4lG5E8X2 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Pabpc4lG5E8X2 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Pabpc4lG5E8X2 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Pabpc4lG5E8X2 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Pabpc4lG5E8X2 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Pabpc4lG5E8X2 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Pabpc4lG5E8X2 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Pabpc4lG5E8X2 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Pabpc4lG5E8X2 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Pabpc4lG5E8X2 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Pabpc4lG5E8X2 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Pabpc4lG5E8X2 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Pabpc4lG5E8X2 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Pabpc4lG5E8X2 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Pabpc4lG5E8X2 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Pabpc4lG5E8X2 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Pabpc4lG5E8X2 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Pabpc4lG5E8X2 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Pabpc4lG5E8X2 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Pabpc4lG5E8X2 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Pabpc4lG5E8X2 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Pabpc4lG5E8X2 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Pabpc4lG5E8X2 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Pabpc4lG5E8X2 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Pabpc4lG5E8X2 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Pabpc4lG5E8X2 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Pabpc4lG5E8X2 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Pabpc4lG5E8X2 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Pabpc4lG5E8X2 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Pabpc4lG5E8X2 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Pabpc4lG5E8X2 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Pabpc4lG5E8X2 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Pabpc4lG5E8X2 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Pabpc4lG5E8X2 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms