Protein–RNA interactions for Protein: G3X939

Slc9a3, Sodium/hydrogen exchanger 3, mousemouse

Predictions only

Length 829 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc9a3G3X939 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Slc9a3G3X939 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Slc9a3G3X939 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Slc9a3G3X939 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Slc9a3G3X939 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Slc9a3G3X939 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Slc9a3G3X939 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Slc9a3G3X939 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Slc9a3G3X939 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Slc9a3G3X939 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Slc9a3G3X939 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Slc9a3G3X939 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Slc9a3G3X939 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Slc9a3G3X939 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Slc9a3G3X939 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Slc9a3G3X939 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Slc9a3G3X939 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Slc9a3G3X939 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Slc9a3G3X939 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Slc9a3G3X939 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Slc9a3G3X939 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Slc9a3G3X939 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Slc9a3G3X939 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Slc9a3G3X939 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Slc9a3G3X939 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Slc9a3G3X939 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Slc9a3G3X939 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Slc9a3G3X939 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Slc9a3G3X939 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Slc9a3G3X939 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Slc9a3G3X939 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Slc9a3G3X939 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Slc9a3G3X939 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Slc9a3G3X939 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Slc9a3G3X939 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Slc9a3G3X939 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Slc9a3G3X939 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Slc9a3G3X939 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Slc9a3G3X939 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Slc9a3G3X939 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Slc9a3G3X939 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Slc9a3G3X939 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Slc9a3G3X939 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Slc9a3G3X939 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Slc9a3G3X939 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Slc9a3G3X939 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Slc9a3G3X939 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Slc9a3G3X939 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Slc9a3G3X939 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Slc9a3G3X939 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Slc9a3G3X939 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Slc9a3G3X939 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Slc9a3G3X939 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Slc9a3G3X939 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Slc9a3G3X939 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Slc9a3G3X939 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Slc9a3G3X939 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Slc9a3G3X939 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Slc9a3G3X939 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Slc9a3G3X939 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Slc9a3G3X939 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Slc9a3G3X939 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Slc9a3G3X939 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Slc9a3G3X939 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Slc9a3G3X939 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Slc9a3G3X939 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Slc9a3G3X939 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Slc9a3G3X939 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Slc9a3G3X939 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Slc9a3G3X939 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Slc9a3G3X939 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Slc9a3G3X939 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Slc9a3G3X939 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Slc9a3G3X939 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Slc9a3G3X939 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Slc9a3G3X939 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Slc9a3G3X939 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Slc9a3G3X939 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Slc9a3G3X939 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Slc9a3G3X939 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Slc9a3G3X939 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Slc9a3G3X939 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Slc9a3G3X939 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Slc9a3G3X939 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Slc9a3G3X939 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Slc9a3G3X939 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Slc9a3G3X939 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Slc9a3G3X939 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Slc9a3G3X939 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Slc9a3G3X939 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Slc9a3G3X939 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Slc9a3G3X939 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Slc9a3G3X939 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Slc9a3G3X939 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Slc9a3G3X939 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Slc9a3G3X939 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Slc9a3G3X939 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Slc9a3G3X939 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Slc9a3G3X939 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Slc9a3G3X939 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms