Protein–RNA interactions for Protein: G3UXB3

Nkx1-1, NK1 homeobox 1, mousemouse

Predictions only

Length 402 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkx1-1G3UXB3 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Nkx1-1G3UXB3 Gm14363-201ENSMUST00000122304 409 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Nkx1-1G3UXB3 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Nkx1-1G3UXB3 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Nkx1-1G3UXB3 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Nkx1-1G3UXB3 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Nkx1-1G3UXB3 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Nkx1-1G3UXB3 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Nkx1-1G3UXB3 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Nkx1-1G3UXB3 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Nkx1-1G3UXB3 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Nkx1-1G3UXB3 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Nkx1-1G3UXB3 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Nkx1-1G3UXB3 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Nkx1-1G3UXB3 Pid1-205ENSMUST00000176720 450 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Nkx1-1G3UXB3 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Nkx1-1G3UXB3 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Nkx1-1G3UXB3 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Nkx1-1G3UXB3 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Nkx1-1G3UXB3 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Nkx1-1G3UXB3 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Nkx1-1G3UXB3 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Nkx1-1G3UXB3 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Nkx1-1G3UXB3 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Nkx1-1G3UXB3 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Nkx1-1G3UXB3 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Nkx1-1G3UXB3 2610203C22Rik-201ENSMUST00000115480 1246 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Nkx1-1G3UXB3 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Nkx1-1G3UXB3 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Nkx1-1G3UXB3 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Nkx1-1G3UXB3 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Nkx1-1G3UXB3 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Nkx1-1G3UXB3 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Nkx1-1G3UXB3 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Nkx1-1G3UXB3 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Nkx1-1G3UXB3 4930433J02Rik-201ENSMUST00000194719 1386 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Nkx1-1G3UXB3 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Nkx1-1G3UXB3 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Nkx1-1G3UXB3 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Nkx1-1G3UXB3 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Nkx1-1G3UXB3 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Nkx1-1G3UXB3 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Nkx1-1G3UXB3 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Nkx1-1G3UXB3 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Nkx1-1G3UXB3 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Nkx1-1G3UXB3 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Nkx1-1G3UXB3 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Nkx1-1G3UXB3 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Nkx1-1G3UXB3 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Nkx1-1G3UXB3 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Nkx1-1G3UXB3 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Nkx1-1G3UXB3 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Nkx1-1G3UXB3 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Nkx1-1G3UXB3 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Nkx1-1G3UXB3 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Nkx1-1G3UXB3 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Nkx1-1G3UXB3 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Nkx1-1G3UXB3 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Nkx1-1G3UXB3 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Nkx1-1G3UXB3 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Nkx1-1G3UXB3 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Nkx1-1G3UXB3 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Nkx1-1G3UXB3 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Nkx1-1G3UXB3 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Nkx1-1G3UXB3 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Nkx1-1G3UXB3 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Nkx1-1G3UXB3 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Nkx1-1G3UXB3 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Nkx1-1G3UXB3 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Nkx1-1G3UXB3 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Nkx1-1G3UXB3 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Nkx1-1G3UXB3 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Nkx1-1G3UXB3 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Nkx1-1G3UXB3 Prl8a1-201ENSMUST00000006664 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Nkx1-1G3UXB3 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Nkx1-1G3UXB3 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Nkx1-1G3UXB3 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Nkx1-1G3UXB3 Gm28877-201ENSMUST00000191349 604 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Nkx1-1G3UXB3 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Nkx1-1G3UXB3 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nkx1-1G3UXB3 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nkx1-1G3UXB3 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nkx1-1G3UXB3 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nkx1-1G3UXB3 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nkx1-1G3UXB3 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nkx1-1G3UXB3 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nkx1-1G3UXB3 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Nkx1-1G3UXB3 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Nkx1-1G3UXB3 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Nkx1-1G3UXB3 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Nkx1-1G3UXB3 4930483J18Rik-202ENSMUST00000138715 1093 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Nkx1-1G3UXB3 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Nkx1-1G3UXB3 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Nkx1-1G3UXB3 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Nkx1-1G3UXB3 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Nkx1-1G3UXB3 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Nkx1-1G3UXB3 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Nkx1-1G3UXB3 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nkx1-1G3UXB3 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nkx1-1G3UXB3 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46 ms