Protein–RNA interactions for Protein: F8VQ07

5830473C10Rik, RIKEN cDNA 5830473C10 gene, mousemouse

Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
5830473C10RikF8VQ07 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
5830473C10RikF8VQ07 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
5830473C10RikF8VQ07 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
5830473C10RikF8VQ07 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
5830473C10RikF8VQ07 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
5830473C10RikF8VQ07 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
5830473C10RikF8VQ07 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
5830473C10RikF8VQ07 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
5830473C10RikF8VQ07 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
5830473C10RikF8VQ07 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
5830473C10RikF8VQ07 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
5830473C10RikF8VQ07 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
5830473C10RikF8VQ07 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
5830473C10RikF8VQ07 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
5830473C10RikF8VQ07 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
5830473C10RikF8VQ07 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
5830473C10RikF8VQ07 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
5830473C10RikF8VQ07 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
5830473C10RikF8VQ07 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
5830473C10RikF8VQ07 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
5830473C10RikF8VQ07 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
5830473C10RikF8VQ07 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
5830473C10RikF8VQ07 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
5830473C10RikF8VQ07 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
5830473C10RikF8VQ07 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
5830473C10RikF8VQ07 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
5830473C10RikF8VQ07 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
5830473C10RikF8VQ07 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
5830473C10RikF8VQ07 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
5830473C10RikF8VQ07 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
5830473C10RikF8VQ07 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
5830473C10RikF8VQ07 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
5830473C10RikF8VQ07 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
5830473C10RikF8VQ07 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
5830473C10RikF8VQ07 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
5830473C10RikF8VQ07 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
5830473C10RikF8VQ07 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
5830473C10RikF8VQ07 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
5830473C10RikF8VQ07 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
5830473C10RikF8VQ07 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
5830473C10RikF8VQ07 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
5830473C10RikF8VQ07 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
5830473C10RikF8VQ07 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
5830473C10RikF8VQ07 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
5830473C10RikF8VQ07 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
5830473C10RikF8VQ07 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
5830473C10RikF8VQ07 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
5830473C10RikF8VQ07 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
5830473C10RikF8VQ07 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
5830473C10RikF8VQ07 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
5830473C10RikF8VQ07 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
5830473C10RikF8VQ07 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
5830473C10RikF8VQ07 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
5830473C10RikF8VQ07 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
5830473C10RikF8VQ07 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
5830473C10RikF8VQ07 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
5830473C10RikF8VQ07 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
5830473C10RikF8VQ07 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
5830473C10RikF8VQ07 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
5830473C10RikF8VQ07 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
5830473C10RikF8VQ07 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
5830473C10RikF8VQ07 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
5830473C10RikF8VQ07 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
5830473C10RikF8VQ07 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
5830473C10RikF8VQ07 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
5830473C10RikF8VQ07 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
5830473C10RikF8VQ07 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
5830473C10RikF8VQ07 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
5830473C10RikF8VQ07 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
5830473C10RikF8VQ07 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
5830473C10RikF8VQ07 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
5830473C10RikF8VQ07 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
5830473C10RikF8VQ07 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
5830473C10RikF8VQ07 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
5830473C10RikF8VQ07 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
5830473C10RikF8VQ07 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
5830473C10RikF8VQ07 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
5830473C10RikF8VQ07 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
5830473C10RikF8VQ07 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
5830473C10RikF8VQ07 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
5830473C10RikF8VQ07 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
5830473C10RikF8VQ07 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
5830473C10RikF8VQ07 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
5830473C10RikF8VQ07 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
5830473C10RikF8VQ07 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
5830473C10RikF8VQ07 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
5830473C10RikF8VQ07 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
5830473C10RikF8VQ07 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
5830473C10RikF8VQ07 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
5830473C10RikF8VQ07 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
5830473C10RikF8VQ07 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
5830473C10RikF8VQ07 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
5830473C10RikF8VQ07 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
5830473C10RikF8VQ07 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
5830473C10RikF8VQ07 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
5830473C10RikF8VQ07 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
5830473C10RikF8VQ07 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
5830473C10RikF8VQ07 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
5830473C10RikF8VQ07 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
5830473C10RikF8VQ07 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.5 ms