Protein–RNA interactions for Protein: F6RGI3

Gm340, Predicted gene 340, mousemouse

Predictions only

Length 1,242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm340F6RGI3 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm340F6RGI3 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm340F6RGI3 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm340F6RGI3 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm340F6RGI3 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm340F6RGI3 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm340F6RGI3 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm340F6RGI3 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm340F6RGI3 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm340F6RGI3 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm340F6RGI3 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm340F6RGI3 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm340F6RGI3 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm340F6RGI3 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm340F6RGI3 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm340F6RGI3 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm340F6RGI3 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm340F6RGI3 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm340F6RGI3 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm340F6RGI3 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Gm340F6RGI3 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm340F6RGI3 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm340F6RGI3 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm340F6RGI3 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm340F6RGI3 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm340F6RGI3 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm340F6RGI3 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm340F6RGI3 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm340F6RGI3 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm340F6RGI3 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm340F6RGI3 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm340F6RGI3 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm340F6RGI3 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm340F6RGI3 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm340F6RGI3 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm340F6RGI3 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm340F6RGI3 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm340F6RGI3 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm340F6RGI3 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm340F6RGI3 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm340F6RGI3 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm340F6RGI3 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm340F6RGI3 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm340F6RGI3 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm340F6RGI3 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm340F6RGI3 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm340F6RGI3 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm340F6RGI3 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm340F6RGI3 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm340F6RGI3 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm340F6RGI3 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm340F6RGI3 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm340F6RGI3 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm340F6RGI3 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm340F6RGI3 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm340F6RGI3 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm340F6RGI3 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm340F6RGI3 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm340F6RGI3 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm340F6RGI3 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm340F6RGI3 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm340F6RGI3 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm340F6RGI3 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm340F6RGI3 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm340F6RGI3 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm340F6RGI3 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm340F6RGI3 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm340F6RGI3 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm340F6RGI3 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm340F6RGI3 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm340F6RGI3 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm340F6RGI3 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm340F6RGI3 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm340F6RGI3 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm340F6RGI3 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm340F6RGI3 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm340F6RGI3 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm340F6RGI3 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm340F6RGI3 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm340F6RGI3 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm340F6RGI3 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm340F6RGI3 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm340F6RGI3 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm340F6RGI3 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm340F6RGI3 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm340F6RGI3 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm340F6RGI3 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm340F6RGI3 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm340F6RGI3 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm340F6RGI3 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm340F6RGI3 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm340F6RGI3 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm340F6RGI3 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm340F6RGI3 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm340F6RGI3 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm340F6RGI3 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm340F6RGI3 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm340F6RGI3 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm340F6RGI3 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm340F6RGI3 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.7 ms