Protein–RNA interactions for Protein: E9QAU8

Rnf165, E3 ubiquitin-protein ligase RNF165, mousemouse

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf165E9QAU8 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rnf165E9QAU8 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rnf165E9QAU8 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rnf165E9QAU8 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rnf165E9QAU8 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rnf165E9QAU8 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rnf165E9QAU8 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rnf165E9QAU8 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rnf165E9QAU8 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rnf165E9QAU8 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rnf165E9QAU8 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rnf165E9QAU8 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rnf165E9QAU8 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rnf165E9QAU8 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rnf165E9QAU8 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rnf165E9QAU8 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rnf165E9QAU8 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rnf165E9QAU8 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rnf165E9QAU8 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rnf165E9QAU8 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rnf165E9QAU8 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Rnf165E9QAU8 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rnf165E9QAU8 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rnf165E9QAU8 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rnf165E9QAU8 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rnf165E9QAU8 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rnf165E9QAU8 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Rnf165E9QAU8 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rnf165E9QAU8 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rnf165E9QAU8 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rnf165E9QAU8 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rnf165E9QAU8 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rnf165E9QAU8 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rnf165E9QAU8 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rnf165E9QAU8 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rnf165E9QAU8 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rnf165E9QAU8 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rnf165E9QAU8 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rnf165E9QAU8 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rnf165E9QAU8 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rnf165E9QAU8 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rnf165E9QAU8 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rnf165E9QAU8 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rnf165E9QAU8 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rnf165E9QAU8 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rnf165E9QAU8 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rnf165E9QAU8 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rnf165E9QAU8 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rnf165E9QAU8 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rnf165E9QAU8 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rnf165E9QAU8 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Rnf165E9QAU8 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rnf165E9QAU8 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rnf165E9QAU8 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rnf165E9QAU8 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rnf165E9QAU8 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rnf165E9QAU8 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rnf165E9QAU8 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rnf165E9QAU8 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rnf165E9QAU8 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rnf165E9QAU8 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rnf165E9QAU8 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rnf165E9QAU8 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rnf165E9QAU8 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Rnf165E9QAU8 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rnf165E9QAU8 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rnf165E9QAU8 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rnf165E9QAU8 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rnf165E9QAU8 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rnf165E9QAU8 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rnf165E9QAU8 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rnf165E9QAU8 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rnf165E9QAU8 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rnf165E9QAU8 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rnf165E9QAU8 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rnf165E9QAU8 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rnf165E9QAU8 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rnf165E9QAU8 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rnf165E9QAU8 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rnf165E9QAU8 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Rnf165E9QAU8 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rnf165E9QAU8 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rnf165E9QAU8 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rnf165E9QAU8 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rnf165E9QAU8 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rnf165E9QAU8 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rnf165E9QAU8 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rnf165E9QAU8 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rnf165E9QAU8 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rnf165E9QAU8 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rnf165E9QAU8 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rnf165E9QAU8 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rnf165E9QAU8 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rnf165E9QAU8 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rnf165E9QAU8 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rnf165E9QAU8 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rnf165E9QAU8 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rnf165E9QAU8 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rnf165E9QAU8 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rnf165E9QAU8 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms