Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9K5

Trdn, Triadin, mousemouse

Predictions only

Length 693 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TrdnE9Q9K5 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TrdnE9Q9K5 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
TrdnE9Q9K5 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TrdnE9Q9K5 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TrdnE9Q9K5 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TrdnE9Q9K5 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TrdnE9Q9K5 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TrdnE9Q9K5 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TrdnE9Q9K5 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
TrdnE9Q9K5 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TrdnE9Q9K5 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TrdnE9Q9K5 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TrdnE9Q9K5 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TrdnE9Q9K5 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC21.77■■□□□ 1.07
TrdnE9Q9K5 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TrdnE9Q9K5 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TrdnE9Q9K5 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TrdnE9Q9K5 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TrdnE9Q9K5 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TrdnE9Q9K5 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
TrdnE9Q9K5 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TrdnE9Q9K5 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TrdnE9Q9K5 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TrdnE9Q9K5 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TrdnE9Q9K5 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TrdnE9Q9K5 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TrdnE9Q9K5 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TrdnE9Q9K5 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TrdnE9Q9K5 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TrdnE9Q9K5 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TrdnE9Q9K5 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TrdnE9Q9K5 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TrdnE9Q9K5 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TrdnE9Q9K5 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TrdnE9Q9K5 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TrdnE9Q9K5 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TrdnE9Q9K5 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TrdnE9Q9K5 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TrdnE9Q9K5 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TrdnE9Q9K5 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
TrdnE9Q9K5 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TrdnE9Q9K5 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TrdnE9Q9K5 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TrdnE9Q9K5 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TrdnE9Q9K5 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TrdnE9Q9K5 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TrdnE9Q9K5 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TrdnE9Q9K5 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TrdnE9Q9K5 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TrdnE9Q9K5 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TrdnE9Q9K5 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
TrdnE9Q9K5 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TrdnE9Q9K5 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TrdnE9Q9K5 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TrdnE9Q9K5 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TrdnE9Q9K5 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TrdnE9Q9K5 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TrdnE9Q9K5 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TrdnE9Q9K5 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TrdnE9Q9K5 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TrdnE9Q9K5 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TrdnE9Q9K5 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
TrdnE9Q9K5 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TrdnE9Q9K5 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
TrdnE9Q9K5 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TrdnE9Q9K5 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TrdnE9Q9K5 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TrdnE9Q9K5 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TrdnE9Q9K5 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TrdnE9Q9K5 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TrdnE9Q9K5 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TrdnE9Q9K5 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TrdnE9Q9K5 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
TrdnE9Q9K5 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TrdnE9Q9K5 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TrdnE9Q9K5 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TrdnE9Q9K5 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
TrdnE9Q9K5 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
TrdnE9Q9K5 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TrdnE9Q9K5 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TrdnE9Q9K5 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TrdnE9Q9K5 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TrdnE9Q9K5 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TrdnE9Q9K5 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TrdnE9Q9K5 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TrdnE9Q9K5 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TrdnE9Q9K5 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TrdnE9Q9K5 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TrdnE9Q9K5 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TrdnE9Q9K5 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TrdnE9Q9K5 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TrdnE9Q9K5 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TrdnE9Q9K5 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
TrdnE9Q9K5 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TrdnE9Q9K5 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TrdnE9Q9K5 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TrdnE9Q9K5 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TrdnE9Q9K5 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TrdnE9Q9K5 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TrdnE9Q9K5 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms