Protein–RNA interactions for Protein: E9Q8Q6

Ccdc141, Coiled-coil domain-containing 141, mousemouse

Predictions only

Length 1,531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc141E9Q8Q6 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Ccdc141E9Q8Q6 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Ccdc141E9Q8Q6 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Ccdc141E9Q8Q6 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Ccdc141E9Q8Q6 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Ccdc141E9Q8Q6 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
Ccdc141E9Q8Q6 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Ccdc141E9Q8Q6 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
Ccdc141E9Q8Q6 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Ccdc141E9Q8Q6 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Ccdc141E9Q8Q6 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Ccdc141E9Q8Q6 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Ccdc141E9Q8Q6 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Ccdc141E9Q8Q6 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Ccdc141E9Q8Q6 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Ccdc141E9Q8Q6 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Ccdc141E9Q8Q6 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Ccdc141E9Q8Q6 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Ccdc141E9Q8Q6 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC28.8■■■□□ 2.2
Ccdc141E9Q8Q6 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC28.8■■■□□ 2.2
Ccdc141E9Q8Q6 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Ccdc141E9Q8Q6 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Ccdc141E9Q8Q6 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Ccdc141E9Q8Q6 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Ccdc141E9Q8Q6 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Ccdc141E9Q8Q6 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
Ccdc141E9Q8Q6 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Ccdc141E9Q8Q6 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Ccdc141E9Q8Q6 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Ccdc141E9Q8Q6 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Ccdc141E9Q8Q6 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Ccdc141E9Q8Q6 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Ccdc141E9Q8Q6 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Ccdc141E9Q8Q6 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Ccdc141E9Q8Q6 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Ccdc141E9Q8Q6 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
Ccdc141E9Q8Q6 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Ccdc141E9Q8Q6 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
Ccdc141E9Q8Q6 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Ccdc141E9Q8Q6 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Ccdc141E9Q8Q6 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Ccdc141E9Q8Q6 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
Ccdc141E9Q8Q6 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Ccdc141E9Q8Q6 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Ccdc141E9Q8Q6 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Ccdc141E9Q8Q6 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC28.77■■■□□ 2.2
Ccdc141E9Q8Q6 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
Ccdc141E9Q8Q6 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Ccdc141E9Q8Q6 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
Ccdc141E9Q8Q6 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
Ccdc141E9Q8Q6 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Ccdc141E9Q8Q6 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC28.76■■■□□ 2.19
Ccdc141E9Q8Q6 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Ccdc141E9Q8Q6 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Ccdc141E9Q8Q6 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Ccdc141E9Q8Q6 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Ccdc141E9Q8Q6 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
Ccdc141E9Q8Q6 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Ccdc141E9Q8Q6 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Ccdc141E9Q8Q6 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Ccdc141E9Q8Q6 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Ccdc141E9Q8Q6 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
Ccdc141E9Q8Q6 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Ccdc141E9Q8Q6 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
Ccdc141E9Q8Q6 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Ccdc141E9Q8Q6 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
Ccdc141E9Q8Q6 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Ccdc141E9Q8Q6 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Ccdc141E9Q8Q6 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Ccdc141E9Q8Q6 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Ccdc141E9Q8Q6 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
Ccdc141E9Q8Q6 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Ccdc141E9Q8Q6 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC28.74■■■□□ 2.19
Ccdc141E9Q8Q6 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Ccdc141E9Q8Q6 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Ccdc141E9Q8Q6 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Ccdc141E9Q8Q6 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
Ccdc141E9Q8Q6 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Ccdc141E9Q8Q6 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Ccdc141E9Q8Q6 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Ccdc141E9Q8Q6 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Ccdc141E9Q8Q6 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Ccdc141E9Q8Q6 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Ccdc141E9Q8Q6 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Ccdc141E9Q8Q6 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Ccdc141E9Q8Q6 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Ccdc141E9Q8Q6 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Ccdc141E9Q8Q6 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Ccdc141E9Q8Q6 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
Ccdc141E9Q8Q6 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Ccdc141E9Q8Q6 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.19
Ccdc141E9Q8Q6 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
Ccdc141E9Q8Q6 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
Ccdc141E9Q8Q6 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
Ccdc141E9Q8Q6 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Ccdc141E9Q8Q6 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Ccdc141E9Q8Q6 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Ccdc141E9Q8Q6 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Ccdc141E9Q8Q6 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Ccdc141E9Q8Q6 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms