Protein–RNA interactions for Protein: E9Q7P1

Col22a1, Collagen, type XXII, alpha 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,613 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col22a1E9Q7P1 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Col22a1E9Q7P1 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Col22a1E9Q7P1 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Col22a1E9Q7P1 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Col22a1E9Q7P1 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Col22a1E9Q7P1 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Col22a1E9Q7P1 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Col22a1E9Q7P1 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Col22a1E9Q7P1 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Col22a1E9Q7P1 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Col22a1E9Q7P1 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Col22a1E9Q7P1 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Col22a1E9Q7P1 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Col22a1E9Q7P1 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Col22a1E9Q7P1 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Col22a1E9Q7P1 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Col22a1E9Q7P1 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Col22a1E9Q7P1 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Col22a1E9Q7P1 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Col22a1E9Q7P1 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Col22a1E9Q7P1 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Col22a1E9Q7P1 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Col22a1E9Q7P1 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Col22a1E9Q7P1 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Col22a1E9Q7P1 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Col22a1E9Q7P1 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Col22a1E9Q7P1 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Col22a1E9Q7P1 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Col22a1E9Q7P1 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Col22a1E9Q7P1 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Col22a1E9Q7P1 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Col22a1E9Q7P1 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Col22a1E9Q7P1 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Col22a1E9Q7P1 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Col22a1E9Q7P1 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Col22a1E9Q7P1 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Col22a1E9Q7P1 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Col22a1E9Q7P1 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Col22a1E9Q7P1 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Col22a1E9Q7P1 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Col22a1E9Q7P1 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Col22a1E9Q7P1 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Col22a1E9Q7P1 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Col22a1E9Q7P1 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Col22a1E9Q7P1 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Col22a1E9Q7P1 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Col22a1E9Q7P1 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Col22a1E9Q7P1 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Col22a1E9Q7P1 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Col22a1E9Q7P1 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Col22a1E9Q7P1 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Col22a1E9Q7P1 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Col22a1E9Q7P1 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Col22a1E9Q7P1 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Col22a1E9Q7P1 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Col22a1E9Q7P1 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Col22a1E9Q7P1 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Col22a1E9Q7P1 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Col22a1E9Q7P1 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Col22a1E9Q7P1 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Col22a1E9Q7P1 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Col22a1E9Q7P1 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Col22a1E9Q7P1 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Col22a1E9Q7P1 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Col22a1E9Q7P1 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Col22a1E9Q7P1 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Col22a1E9Q7P1 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Col22a1E9Q7P1 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Col22a1E9Q7P1 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Col22a1E9Q7P1 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Col22a1E9Q7P1 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Col22a1E9Q7P1 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Col22a1E9Q7P1 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Col22a1E9Q7P1 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Col22a1E9Q7P1 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Col22a1E9Q7P1 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Col22a1E9Q7P1 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Col22a1E9Q7P1 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Col22a1E9Q7P1 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Col22a1E9Q7P1 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Col22a1E9Q7P1 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Col22a1E9Q7P1 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Col22a1E9Q7P1 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Col22a1E9Q7P1 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Col22a1E9Q7P1 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Col22a1E9Q7P1 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Col22a1E9Q7P1 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Col22a1E9Q7P1 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Col22a1E9Q7P1 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Col22a1E9Q7P1 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Col22a1E9Q7P1 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Col22a1E9Q7P1 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Col22a1E9Q7P1 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Col22a1E9Q7P1 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Col22a1E9Q7P1 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Col22a1E9Q7P1 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Col22a1E9Q7P1 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Col22a1E9Q7P1 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Col22a1E9Q7P1 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Col22a1E9Q7P1 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.8 ms