Protein–RNA interactions for Protein: E9Q612

Ptpro, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase O, mousemouse

Predictions only

Length 1,226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtproE9Q612 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PtproE9Q612 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PtproE9Q612 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PtproE9Q612 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PtproE9Q612 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PtproE9Q612 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PtproE9Q612 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PtproE9Q612 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PtproE9Q612 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PtproE9Q612 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
PtproE9Q612 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PtproE9Q612 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PtproE9Q612 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PtproE9Q612 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PtproE9Q612 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PtproE9Q612 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PtproE9Q612 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PtproE9Q612 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PtproE9Q612 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PtproE9Q612 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PtproE9Q612 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PtproE9Q612 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PtproE9Q612 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PtproE9Q612 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PtproE9Q612 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PtproE9Q612 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PtproE9Q612 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PtproE9Q612 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PtproE9Q612 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PtproE9Q612 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PtproE9Q612 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PtproE9Q612 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PtproE9Q612 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PtproE9Q612 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PtproE9Q612 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PtproE9Q612 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PtproE9Q612 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PtproE9Q612 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PtproE9Q612 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PtproE9Q612 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PtproE9Q612 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PtproE9Q612 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PtproE9Q612 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PtproE9Q612 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PtproE9Q612 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PtproE9Q612 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PtproE9Q612 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PtproE9Q612 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PtproE9Q612 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PtproE9Q612 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PtproE9Q612 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PtproE9Q612 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PtproE9Q612 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PtproE9Q612 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PtproE9Q612 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PtproE9Q612 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PtproE9Q612 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PtproE9Q612 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PtproE9Q612 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PtproE9Q612 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PtproE9Q612 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PtproE9Q612 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PtproE9Q612 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PtproE9Q612 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PtproE9Q612 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PtproE9Q612 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PtproE9Q612 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PtproE9Q612 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PtproE9Q612 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PtproE9Q612 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
PtproE9Q612 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PtproE9Q612 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PtproE9Q612 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PtproE9Q612 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PtproE9Q612 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PtproE9Q612 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PtproE9Q612 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PtproE9Q612 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PtproE9Q612 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PtproE9Q612 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PtproE9Q612 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PtproE9Q612 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PtproE9Q612 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PtproE9Q612 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PtproE9Q612 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PtproE9Q612 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PtproE9Q612 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PtproE9Q612 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PtproE9Q612 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
PtproE9Q612 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PtproE9Q612 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PtproE9Q612 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PtproE9Q612 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PtproE9Q612 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PtproE9Q612 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PtproE9Q612 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PtproE9Q612 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
PtproE9Q612 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PtproE9Q612 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PtproE9Q612 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.4 ms