Protein–RNA interactions for Protein: E9Q5D8

Vmn2r48, Vomeronasal 2, receptor 48, mousemouse

Predictions only

Length 855 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn2r48E9Q5D8 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Vmn2r48E9Q5D8 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Vmn2r48E9Q5D8 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Vmn2r48E9Q5D8 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Vmn2r48E9Q5D8 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Vmn2r48E9Q5D8 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Vmn2r48E9Q5D8 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Vmn2r48E9Q5D8 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Vmn2r48E9Q5D8 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Vmn2r48E9Q5D8 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Vmn2r48E9Q5D8 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Vmn2r48E9Q5D8 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Vmn2r48E9Q5D8 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Vmn2r48E9Q5D8 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Vmn2r48E9Q5D8 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Vmn2r48E9Q5D8 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Vmn2r48E9Q5D8 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Vmn2r48E9Q5D8 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Vmn2r48E9Q5D8 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Vmn2r48E9Q5D8 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Vmn2r48E9Q5D8 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Vmn2r48E9Q5D8 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Vmn2r48E9Q5D8 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Vmn2r48E9Q5D8 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Vmn2r48E9Q5D8 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Vmn2r48E9Q5D8 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Vmn2r48E9Q5D8 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Vmn2r48E9Q5D8 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Vmn2r48E9Q5D8 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Vmn2r48E9Q5D8 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Vmn2r48E9Q5D8 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Vmn2r48E9Q5D8 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Vmn2r48E9Q5D8 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Vmn2r48E9Q5D8 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Vmn2r48E9Q5D8 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Vmn2r48E9Q5D8 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Vmn2r48E9Q5D8 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Vmn2r48E9Q5D8 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Vmn2r48E9Q5D8 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Vmn2r48E9Q5D8 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Vmn2r48E9Q5D8 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Vmn2r48E9Q5D8 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Vmn2r48E9Q5D8 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Vmn2r48E9Q5D8 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Vmn2r48E9Q5D8 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Vmn2r48E9Q5D8 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Vmn2r48E9Q5D8 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Vmn2r48E9Q5D8 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Vmn2r48E9Q5D8 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Vmn2r48E9Q5D8 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Vmn2r48E9Q5D8 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Vmn2r48E9Q5D8 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Vmn2r48E9Q5D8 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Vmn2r48E9Q5D8 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Vmn2r48E9Q5D8 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Vmn2r48E9Q5D8 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Vmn2r48E9Q5D8 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Vmn2r48E9Q5D8 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Vmn2r48E9Q5D8 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Vmn2r48E9Q5D8 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vmn2r48E9Q5D8 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vmn2r48E9Q5D8 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Vmn2r48E9Q5D8 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vmn2r48E9Q5D8 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vmn2r48E9Q5D8 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vmn2r48E9Q5D8 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vmn2r48E9Q5D8 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vmn2r48E9Q5D8 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Vmn2r48E9Q5D8 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vmn2r48E9Q5D8 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vmn2r48E9Q5D8 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vmn2r48E9Q5D8 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vmn2r48E9Q5D8 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Vmn2r48E9Q5D8 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Vmn2r48E9Q5D8 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Vmn2r48E9Q5D8 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Vmn2r48E9Q5D8 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Vmn2r48E9Q5D8 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Vmn2r48E9Q5D8 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Vmn2r48E9Q5D8 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Vmn2r48E9Q5D8 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Vmn2r48E9Q5D8 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Vmn2r48E9Q5D8 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Vmn2r48E9Q5D8 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Vmn2r48E9Q5D8 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Vmn2r48E9Q5D8 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Vmn2r48E9Q5D8 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Vmn2r48E9Q5D8 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Vmn2r48E9Q5D8 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Vmn2r48E9Q5D8 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Vmn2r48E9Q5D8 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Vmn2r48E9Q5D8 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Vmn2r48E9Q5D8 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Vmn2r48E9Q5D8 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Vmn2r48E9Q5D8 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Vmn2r48E9Q5D8 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Vmn2r48E9Q5D8 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Vmn2r48E9Q5D8 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Vmn2r48E9Q5D8 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Vmn2r48E9Q5D8 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms