Protein–RNA interactions for Protein: E9Q3L6

4930579F01Rik, RIKEN cDNA 4930579F01 gene, mousemouse

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930579F01RikE9Q3L6 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
4930579F01RikE9Q3L6 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
4930579F01RikE9Q3L6 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
4930579F01RikE9Q3L6 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
4930579F01RikE9Q3L6 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
4930579F01RikE9Q3L6 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
4930579F01RikE9Q3L6 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
4930579F01RikE9Q3L6 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
4930579F01RikE9Q3L6 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
4930579F01RikE9Q3L6 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
4930579F01RikE9Q3L6 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
4930579F01RikE9Q3L6 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
4930579F01RikE9Q3L6 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
4930579F01RikE9Q3L6 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
4930579F01RikE9Q3L6 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
4930579F01RikE9Q3L6 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
4930579F01RikE9Q3L6 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
4930579F01RikE9Q3L6 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
4930579F01RikE9Q3L6 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
4930579F01RikE9Q3L6 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
4930579F01RikE9Q3L6 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
4930579F01RikE9Q3L6 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
4930579F01RikE9Q3L6 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
4930579F01RikE9Q3L6 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
4930579F01RikE9Q3L6 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
4930579F01RikE9Q3L6 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
4930579F01RikE9Q3L6 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
4930579F01RikE9Q3L6 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
4930579F01RikE9Q3L6 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
4930579F01RikE9Q3L6 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
4930579F01RikE9Q3L6 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
4930579F01RikE9Q3L6 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
4930579F01RikE9Q3L6 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
4930579F01RikE9Q3L6 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
4930579F01RikE9Q3L6 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
4930579F01RikE9Q3L6 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
4930579F01RikE9Q3L6 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
4930579F01RikE9Q3L6 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
4930579F01RikE9Q3L6 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
4930579F01RikE9Q3L6 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
4930579F01RikE9Q3L6 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
4930579F01RikE9Q3L6 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
4930579F01RikE9Q3L6 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
4930579F01RikE9Q3L6 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
4930579F01RikE9Q3L6 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
4930579F01RikE9Q3L6 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
4930579F01RikE9Q3L6 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
4930579F01RikE9Q3L6 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
4930579F01RikE9Q3L6 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
4930579F01RikE9Q3L6 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
4930579F01RikE9Q3L6 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
4930579F01RikE9Q3L6 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
4930579F01RikE9Q3L6 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
4930579F01RikE9Q3L6 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
4930579F01RikE9Q3L6 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
4930579F01RikE9Q3L6 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
4930579F01RikE9Q3L6 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
4930579F01RikE9Q3L6 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
4930579F01RikE9Q3L6 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
4930579F01RikE9Q3L6 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
4930579F01RikE9Q3L6 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
4930579F01RikE9Q3L6 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
4930579F01RikE9Q3L6 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
4930579F01RikE9Q3L6 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
4930579F01RikE9Q3L6 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
4930579F01RikE9Q3L6 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
4930579F01RikE9Q3L6 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
4930579F01RikE9Q3L6 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
4930579F01RikE9Q3L6 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
4930579F01RikE9Q3L6 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
4930579F01RikE9Q3L6 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
4930579F01RikE9Q3L6 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
4930579F01RikE9Q3L6 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
4930579F01RikE9Q3L6 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
4930579F01RikE9Q3L6 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
4930579F01RikE9Q3L6 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
4930579F01RikE9Q3L6 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
4930579F01RikE9Q3L6 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
4930579F01RikE9Q3L6 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
4930579F01RikE9Q3L6 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
4930579F01RikE9Q3L6 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
4930579F01RikE9Q3L6 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
4930579F01RikE9Q3L6 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
4930579F01RikE9Q3L6 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
4930579F01RikE9Q3L6 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
4930579F01RikE9Q3L6 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
4930579F01RikE9Q3L6 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
4930579F01RikE9Q3L6 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
4930579F01RikE9Q3L6 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
4930579F01RikE9Q3L6 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
4930579F01RikE9Q3L6 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
4930579F01RikE9Q3L6 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
4930579F01RikE9Q3L6 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
4930579F01RikE9Q3L6 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
4930579F01RikE9Q3L6 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
4930579F01RikE9Q3L6 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
4930579F01RikE9Q3L6 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
4930579F01RikE9Q3L6 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
4930579F01RikE9Q3L6 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
4930579F01RikE9Q3L6 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms