Protein–RNA interactions for Protein: E9Q3J7

Gm3020, Predicted gene 3020, mousemouse

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Length 150 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3020E9Q3J7 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm3020E9Q3J7 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm3020E9Q3J7 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm3020E9Q3J7 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm3020E9Q3J7 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm3020E9Q3J7 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm3020E9Q3J7 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm3020E9Q3J7 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm3020E9Q3J7 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm3020E9Q3J7 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm3020E9Q3J7 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm3020E9Q3J7 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm3020E9Q3J7 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm3020E9Q3J7 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm3020E9Q3J7 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm3020E9Q3J7 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm3020E9Q3J7 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm3020E9Q3J7 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm3020E9Q3J7 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm3020E9Q3J7 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm3020E9Q3J7 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm3020E9Q3J7 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm3020E9Q3J7 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm3020E9Q3J7 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm3020E9Q3J7 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm3020E9Q3J7 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm3020E9Q3J7 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
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Gm3020E9Q3J7 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm3020E9Q3J7 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm3020E9Q3J7 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm3020E9Q3J7 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm3020E9Q3J7 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm3020E9Q3J7 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm3020E9Q3J7 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm3020E9Q3J7 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm3020E9Q3J7 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm3020E9Q3J7 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm3020E9Q3J7 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
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Gm3020E9Q3J7 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm3020E9Q3J7 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
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Gm3020E9Q3J7 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm3020E9Q3J7 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm3020E9Q3J7 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm3020E9Q3J7 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm3020E9Q3J7 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm3020E9Q3J7 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm3020E9Q3J7 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm3020E9Q3J7 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm3020E9Q3J7 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
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Gm3020E9Q3J7 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm3020E9Q3J7 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
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Gm3020E9Q3J7 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm3020E9Q3J7 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm3020E9Q3J7 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
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Gm3020E9Q3J7 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm3020E9Q3J7 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm3020E9Q3J7 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
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Gm3020E9Q3J7 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
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Gm3020E9Q3J7 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm3020E9Q3J7 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
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Gm3020E9Q3J7 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm3020E9Q3J7 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm3020E9Q3J7 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm3020E9Q3J7 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm3020E9Q3J7 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm3020E9Q3J7 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm3020E9Q3J7 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm3020E9Q3J7 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm3020E9Q3J7 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm3020E9Q3J7 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm3020E9Q3J7 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm3020E9Q3J7 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm3020E9Q3J7 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm3020E9Q3J7 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm3020E9Q3J7 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm3020E9Q3J7 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm3020E9Q3J7 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm3020E9Q3J7 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms