Protein–RNA interactions for Protein: E9Q373

Vmn1r238, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 306 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r238E9Q373 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Vmn1r238E9Q373 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Vmn1r238E9Q373 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Vmn1r238E9Q373 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Vmn1r238E9Q373 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Vmn1r238E9Q373 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Vmn1r238E9Q373 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Vmn1r238E9Q373 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Vmn1r238E9Q373 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Vmn1r238E9Q373 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
Vmn1r238E9Q373 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Vmn1r238E9Q373 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Vmn1r238E9Q373 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Vmn1r238E9Q373 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Vmn1r238E9Q373 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Vmn1r238E9Q373 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Vmn1r238E9Q373 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Vmn1r238E9Q373 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Vmn1r238E9Q373 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Vmn1r238E9Q373 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Vmn1r238E9Q373 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Vmn1r238E9Q373 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Vmn1r238E9Q373 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Vmn1r238E9Q373 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Vmn1r238E9Q373 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Vmn1r238E9Q373 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Vmn1r238E9Q373 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Vmn1r238E9Q373 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Vmn1r238E9Q373 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Vmn1r238E9Q373 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Vmn1r238E9Q373 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Vmn1r238E9Q373 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Vmn1r238E9Q373 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Vmn1r238E9Q373 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Vmn1r238E9Q373 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Vmn1r238E9Q373 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Vmn1r238E9Q373 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Vmn1r238E9Q373 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Vmn1r238E9Q373 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Vmn1r238E9Q373 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Vmn1r238E9Q373 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Vmn1r238E9Q373 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Vmn1r238E9Q373 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Vmn1r238E9Q373 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Vmn1r238E9Q373 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Vmn1r238E9Q373 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Vmn1r238E9Q373 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Vmn1r238E9Q373 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Vmn1r238E9Q373 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Vmn1r238E9Q373 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Vmn1r238E9Q373 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Vmn1r238E9Q373 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Vmn1r238E9Q373 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Vmn1r238E9Q373 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Vmn1r238E9Q373 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Vmn1r238E9Q373 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Vmn1r238E9Q373 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Vmn1r238E9Q373 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Vmn1r238E9Q373 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Vmn1r238E9Q373 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Vmn1r238E9Q373 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Vmn1r238E9Q373 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Vmn1r238E9Q373 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Vmn1r238E9Q373 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Vmn1r238E9Q373 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Vmn1r238E9Q373 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Vmn1r238E9Q373 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Vmn1r238E9Q373 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Vmn1r238E9Q373 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Vmn1r238E9Q373 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Vmn1r238E9Q373 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Vmn1r238E9Q373 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Vmn1r238E9Q373 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Vmn1r238E9Q373 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Vmn1r238E9Q373 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Vmn1r238E9Q373 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Vmn1r238E9Q373 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Vmn1r238E9Q373 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Vmn1r238E9Q373 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Vmn1r238E9Q373 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Vmn1r238E9Q373 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Vmn1r238E9Q373 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Vmn1r238E9Q373 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Vmn1r238E9Q373 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Vmn1r238E9Q373 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Vmn1r238E9Q373 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Vmn1r238E9Q373 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Vmn1r238E9Q373 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Vmn1r238E9Q373 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Vmn1r238E9Q373 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Vmn1r238E9Q373 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Vmn1r238E9Q373 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Vmn1r238E9Q373 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Vmn1r238E9Q373 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Vmn1r238E9Q373 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Vmn1r238E9Q373 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Vmn1r238E9Q373 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Vmn1r238E9Q373 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Vmn1r238E9Q373 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Vmn1r238E9Q373 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms