Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1M1

Pdzd2, PDZ domain-containing 2, mousemouse

Predictions only

Length 2,796 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzd2E9Q1M1 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Pdzd2E9Q1M1 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Pdzd2E9Q1M1 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Pdzd2E9Q1M1 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Pdzd2E9Q1M1 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Pdzd2E9Q1M1 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
Pdzd2E9Q1M1 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Pdzd2E9Q1M1 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pdzd2E9Q1M1 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pdzd2E9Q1M1 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pdzd2E9Q1M1 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pdzd2E9Q1M1 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pdzd2E9Q1M1 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pdzd2E9Q1M1 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pdzd2E9Q1M1 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pdzd2E9Q1M1 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pdzd2E9Q1M1 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pdzd2E9Q1M1 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pdzd2E9Q1M1 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
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Pdzd2E9Q1M1 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Pdzd2E9Q1M1 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pdzd2E9Q1M1 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pdzd2E9Q1M1 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
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Pdzd2E9Q1M1 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pdzd2E9Q1M1 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pdzd2E9Q1M1 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pdzd2E9Q1M1 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
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Pdzd2E9Q1M1 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pdzd2E9Q1M1 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
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Pdzd2E9Q1M1 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pdzd2E9Q1M1 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pdzd2E9Q1M1 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
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Pdzd2E9Q1M1 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Pdzd2E9Q1M1 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Pdzd2E9Q1M1 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Pdzd2E9Q1M1 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
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Pdzd2E9Q1M1 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
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Pdzd2E9Q1M1 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
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Pdzd2E9Q1M1 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pdzd2E9Q1M1 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pdzd2E9Q1M1 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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Pdzd2E9Q1M1 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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Pdzd2E9Q1M1 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Pdzd2E9Q1M1 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Pdzd2E9Q1M1 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Pdzd2E9Q1M1 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Pdzd2E9Q1M1 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Pdzd2E9Q1M1 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Pdzd2E9Q1M1 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Pdzd2E9Q1M1 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Pdzd2E9Q1M1 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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Pdzd2E9Q1M1 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Pdzd2E9Q1M1 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Pdzd2E9Q1M1 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Pdzd2E9Q1M1 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Pdzd2E9Q1M1 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Pdzd2E9Q1M1 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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