Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1J0

Zfp558, Zinc finger protein 558, mousemouse

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Length 407 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp558E9Q1J0 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Zfp558E9Q1J0 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Zfp558E9Q1J0 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Zfp558E9Q1J0 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Zfp558E9Q1J0 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Zfp558E9Q1J0 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Zfp558E9Q1J0 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Zfp558E9Q1J0 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Zfp558E9Q1J0 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Zfp558E9Q1J0 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Zfp558E9Q1J0 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Zfp558E9Q1J0 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Zfp558E9Q1J0 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Zfp558E9Q1J0 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Zfp558E9Q1J0 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Zfp558E9Q1J0 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Zfp558E9Q1J0 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Zfp558E9Q1J0 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Zfp558E9Q1J0 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Zfp558E9Q1J0 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Zfp558E9Q1J0 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Zfp558E9Q1J0 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Zfp558E9Q1J0 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Zfp558E9Q1J0 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Zfp558E9Q1J0 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Zfp558E9Q1J0 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Zfp558E9Q1J0 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Zfp558E9Q1J0 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Zfp558E9Q1J0 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Zfp558E9Q1J0 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Zfp558E9Q1J0 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Zfp558E9Q1J0 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Zfp558E9Q1J0 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Zfp558E9Q1J0 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Zfp558E9Q1J0 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Zfp558E9Q1J0 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Zfp558E9Q1J0 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Zfp558E9Q1J0 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Zfp558E9Q1J0 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Zfp558E9Q1J0 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Zfp558E9Q1J0 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Zfp558E9Q1J0 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Zfp558E9Q1J0 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Zfp558E9Q1J0 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Zfp558E9Q1J0 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Zfp558E9Q1J0 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Zfp558E9Q1J0 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Zfp558E9Q1J0 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Zfp558E9Q1J0 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Zfp558E9Q1J0 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Zfp558E9Q1J0 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Zfp558E9Q1J0 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Zfp558E9Q1J0 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
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Zfp558E9Q1J0 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Zfp558E9Q1J0 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Zfp558E9Q1J0 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Zfp558E9Q1J0 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Zfp558E9Q1J0 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
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Zfp558E9Q1J0 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Zfp558E9Q1J0 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Zfp558E9Q1J0 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Zfp558E9Q1J0 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Zfp558E9Q1J0 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Zfp558E9Q1J0 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Zfp558E9Q1J0 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Zfp558E9Q1J0 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Zfp558E9Q1J0 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Zfp558E9Q1J0 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Zfp558E9Q1J0 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Zfp558E9Q1J0 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Zfp558E9Q1J0 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Zfp558E9Q1J0 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
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Zfp558E9Q1J0 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Zfp558E9Q1J0 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Zfp558E9Q1J0 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Zfp558E9Q1J0 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Zfp558E9Q1J0 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Zfp558E9Q1J0 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Zfp558E9Q1J0 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Zfp558E9Q1J0 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Zfp558E9Q1J0 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Zfp558E9Q1J0 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Zfp558E9Q1J0 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Zfp558E9Q1J0 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Zfp558E9Q1J0 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Zfp558E9Q1J0 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Zfp558E9Q1J0 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Zfp558E9Q1J0 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Zfp558E9Q1J0 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Zfp558E9Q1J0 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Zfp558E9Q1J0 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Zfp558E9Q1J0 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Zfp558E9Q1J0 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Zfp558E9Q1J0 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Zfp558E9Q1J0 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Zfp558E9Q1J0 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
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