Protein–RNA interactions for Protein: E9PZM7

Scaf11, SR-related CTD-associated factor 11, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,456 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scaf11E9PZM7 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Scaf11E9PZM7 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
Scaf11E9PZM7 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Scaf11E9PZM7 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Scaf11E9PZM7 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Scaf11E9PZM7 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Scaf11E9PZM7 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.86
Scaf11E9PZM7 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
Scaf11E9PZM7 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
Scaf11E9PZM7 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Scaf11E9PZM7 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC26.64■■□□□ 1.86
Scaf11E9PZM7 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC26.64■■□□□ 1.86
Scaf11E9PZM7 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Scaf11E9PZM7 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC26.64■■□□□ 1.85
Scaf11E9PZM7 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Scaf11E9PZM7 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Scaf11E9PZM7 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Scaf11E9PZM7 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Scaf11E9PZM7 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
Scaf11E9PZM7 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
Scaf11E9PZM7 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Scaf11E9PZM7 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Scaf11E9PZM7 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Scaf11E9PZM7 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Scaf11E9PZM7 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Scaf11E9PZM7 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Scaf11E9PZM7 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Scaf11E9PZM7 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Scaf11E9PZM7 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Scaf11E9PZM7 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Scaf11E9PZM7 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Scaf11E9PZM7 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Scaf11E9PZM7 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
Scaf11E9PZM7 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Scaf11E9PZM7 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Scaf11E9PZM7 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Scaf11E9PZM7 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Scaf11E9PZM7 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Scaf11E9PZM7 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Scaf11E9PZM7 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Scaf11E9PZM7 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Scaf11E9PZM7 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Scaf11E9PZM7 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Scaf11E9PZM7 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Scaf11E9PZM7 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Scaf11E9PZM7 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Scaf11E9PZM7 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Scaf11E9PZM7 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
Scaf11E9PZM7 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
Scaf11E9PZM7 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Scaf11E9PZM7 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Scaf11E9PZM7 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Scaf11E9PZM7 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Scaf11E9PZM7 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Scaf11E9PZM7 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Scaf11E9PZM7 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Scaf11E9PZM7 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Scaf11E9PZM7 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Scaf11E9PZM7 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Scaf11E9PZM7 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Scaf11E9PZM7 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Scaf11E9PZM7 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Scaf11E9PZM7 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
Scaf11E9PZM7 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Scaf11E9PZM7 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
Scaf11E9PZM7 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Scaf11E9PZM7 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Scaf11E9PZM7 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Scaf11E9PZM7 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Scaf11E9PZM7 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
Scaf11E9PZM7 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Scaf11E9PZM7 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
Scaf11E9PZM7 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Scaf11E9PZM7 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Scaf11E9PZM7 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Scaf11E9PZM7 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Scaf11E9PZM7 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Scaf11E9PZM7 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Scaf11E9PZM7 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Scaf11E9PZM7 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Scaf11E9PZM7 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Scaf11E9PZM7 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Scaf11E9PZM7 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Scaf11E9PZM7 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Scaf11E9PZM7 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Scaf11E9PZM7 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Scaf11E9PZM7 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
Scaf11E9PZM7 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Scaf11E9PZM7 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Scaf11E9PZM7 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
Scaf11E9PZM7 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Scaf11E9PZM7 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Scaf11E9PZM7 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Scaf11E9PZM7 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Scaf11E9PZM7 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Scaf11E9PZM7 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Scaf11E9PZM7 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Scaf11E9PZM7 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
Scaf11E9PZM7 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
Scaf11E9PZM7 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.8 ms