Protein–RNA interactions for Protein: E9PZM4

Chd2, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,827 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chd2E9PZM4 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Chd2E9PZM4 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Chd2E9PZM4 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Chd2E9PZM4 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Chd2E9PZM4 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Chd2E9PZM4 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Chd2E9PZM4 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
Chd2E9PZM4 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Chd2E9PZM4 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Chd2E9PZM4 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Chd2E9PZM4 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Chd2E9PZM4 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Chd2E9PZM4 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Chd2E9PZM4 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Chd2E9PZM4 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Chd2E9PZM4 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Chd2E9PZM4 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Chd2E9PZM4 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
Chd2E9PZM4 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Chd2E9PZM4 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Chd2E9PZM4 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Chd2E9PZM4 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Chd2E9PZM4 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Chd2E9PZM4 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Chd2E9PZM4 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Chd2E9PZM4 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Chd2E9PZM4 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Chd2E9PZM4 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
Chd2E9PZM4 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
Chd2E9PZM4 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Chd2E9PZM4 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Chd2E9PZM4 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Chd2E9PZM4 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Chd2E9PZM4 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Chd2E9PZM4 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Chd2E9PZM4 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Chd2E9PZM4 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Chd2E9PZM4 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
Chd2E9PZM4 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Chd2E9PZM4 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Chd2E9PZM4 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Chd2E9PZM4 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Chd2E9PZM4 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Chd2E9PZM4 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Chd2E9PZM4 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Chd2E9PZM4 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Chd2E9PZM4 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Chd2E9PZM4 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Chd2E9PZM4 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Chd2E9PZM4 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Chd2E9PZM4 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Chd2E9PZM4 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Chd2E9PZM4 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Chd2E9PZM4 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Chd2E9PZM4 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Chd2E9PZM4 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
Chd2E9PZM4 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
Chd2E9PZM4 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
Chd2E9PZM4 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Chd2E9PZM4 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Chd2E9PZM4 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
Chd2E9PZM4 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Chd2E9PZM4 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Chd2E9PZM4 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Chd2E9PZM4 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Chd2E9PZM4 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Chd2E9PZM4 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Chd2E9PZM4 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Chd2E9PZM4 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
Chd2E9PZM4 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Chd2E9PZM4 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Chd2E9PZM4 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Chd2E9PZM4 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Chd2E9PZM4 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
Chd2E9PZM4 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Chd2E9PZM4 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Chd2E9PZM4 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
Chd2E9PZM4 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
Chd2E9PZM4 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
Chd2E9PZM4 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Chd2E9PZM4 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
Chd2E9PZM4 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Chd2E9PZM4 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Chd2E9PZM4 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Chd2E9PZM4 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Chd2E9PZM4 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Chd2E9PZM4 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Chd2E9PZM4 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Chd2E9PZM4 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
Chd2E9PZM4 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Chd2E9PZM4 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Chd2E9PZM4 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Chd2E9PZM4 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Chd2E9PZM4 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Chd2E9PZM4 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Chd2E9PZM4 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Chd2E9PZM4 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Chd2E9PZM4 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Chd2E9PZM4 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Chd2E9PZM4 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms