Protein–RNA interactions for Protein: D3YYH9

Gm498, Predicted gene 498, mousemouse

Predictions only

Length 372 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm498D3YYH9 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm498D3YYH9 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm498D3YYH9 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm498D3YYH9 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm498D3YYH9 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm498D3YYH9 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm498D3YYH9 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm498D3YYH9 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm498D3YYH9 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm498D3YYH9 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm498D3YYH9 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm498D3YYH9 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm498D3YYH9 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm498D3YYH9 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm498D3YYH9 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm498D3YYH9 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm498D3YYH9 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm498D3YYH9 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm498D3YYH9 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm498D3YYH9 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm498D3YYH9 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm498D3YYH9 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm498D3YYH9 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm498D3YYH9 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm498D3YYH9 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm498D3YYH9 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm498D3YYH9 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm498D3YYH9 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm498D3YYH9 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm498D3YYH9 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm498D3YYH9 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm498D3YYH9 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm498D3YYH9 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm498D3YYH9 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm498D3YYH9 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm498D3YYH9 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm498D3YYH9 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm498D3YYH9 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm498D3YYH9 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm498D3YYH9 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm498D3YYH9 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm498D3YYH9 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm498D3YYH9 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm498D3YYH9 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm498D3YYH9 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm498D3YYH9 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.34
Gm498D3YYH9 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm498D3YYH9 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm498D3YYH9 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm498D3YYH9 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm498D3YYH9 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm498D3YYH9 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm498D3YYH9 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm498D3YYH9 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm498D3YYH9 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm498D3YYH9 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm498D3YYH9 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm498D3YYH9 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm498D3YYH9 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm498D3YYH9 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm498D3YYH9 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm498D3YYH9 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm498D3YYH9 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm498D3YYH9 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm498D3YYH9 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm498D3YYH9 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm498D3YYH9 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm498D3YYH9 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm498D3YYH9 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm498D3YYH9 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm498D3YYH9 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm498D3YYH9 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm498D3YYH9 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm498D3YYH9 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm498D3YYH9 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm498D3YYH9 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm498D3YYH9 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm498D3YYH9 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm498D3YYH9 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm498D3YYH9 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm498D3YYH9 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gm498D3YYH9 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gm498D3YYH9 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gm498D3YYH9 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gm498D3YYH9 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Gm498D3YYH9 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gm498D3YYH9 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gm498D3YYH9 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gm498D3YYH9 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gm498D3YYH9 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gm498D3YYH9 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gm498D3YYH9 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gm498D3YYH9 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gm498D3YYH9 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gm498D3YYH9 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gm498D3YYH9 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gm498D3YYH9 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gm498D3YYH9 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gm498D3YYH9 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gm498D3YYH9 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms